Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5L0

TNPO3, Transportin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 923 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNPO3Q9Y5L0 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TNPO3Q9Y5L0 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TNPO3Q9Y5L0 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TNPO3Q9Y5L0 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TNPO3Q9Y5L0 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TNPO3Q9Y5L0 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
TNPO3Q9Y5L0 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TNPO3Q9Y5L0 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TNPO3Q9Y5L0 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TNPO3Q9Y5L0 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TNPO3Q9Y5L0 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TNPO3Q9Y5L0 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TNPO3Q9Y5L0 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TNPO3Q9Y5L0 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TNPO3Q9Y5L0 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TNPO3Q9Y5L0 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TNPO3Q9Y5L0 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TNPO3Q9Y5L0 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TNPO3Q9Y5L0 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TNPO3Q9Y5L0 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TNPO3Q9Y5L0 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TNPO3Q9Y5L0 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TNPO3Q9Y5L0 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TNPO3Q9Y5L0 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TNPO3Q9Y5L0 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TNPO3Q9Y5L0 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TNPO3Q9Y5L0 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
TNPO3Q9Y5L0 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TNPO3Q9Y5L0 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TNPO3Q9Y5L0 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TNPO3Q9Y5L0 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TNPO3Q9Y5L0 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TNPO3Q9Y5L0 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TNPO3Q9Y5L0 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TNPO3Q9Y5L0 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TNPO3Q9Y5L0 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TNPO3Q9Y5L0 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TNPO3Q9Y5L0 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TNPO3Q9Y5L0 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
TNPO3Q9Y5L0 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TNPO3Q9Y5L0 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TNPO3Q9Y5L0 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TNPO3Q9Y5L0 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TNPO3Q9Y5L0 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TNPO3Q9Y5L0 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TNPO3Q9Y5L0 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TNPO3Q9Y5L0 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TNPO3Q9Y5L0 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TNPO3Q9Y5L0 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TNPO3Q9Y5L0 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TNPO3Q9Y5L0 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TNPO3Q9Y5L0 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TNPO3Q9Y5L0 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TNPO3Q9Y5L0 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
TNPO3Q9Y5L0 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
TNPO3Q9Y5L0 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TNPO3Q9Y5L0 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TNPO3Q9Y5L0 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TNPO3Q9Y5L0 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TNPO3Q9Y5L0 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TNPO3Q9Y5L0 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TNPO3Q9Y5L0 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TNPO3Q9Y5L0 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TNPO3Q9Y5L0 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TNPO3Q9Y5L0 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TNPO3Q9Y5L0 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TNPO3Q9Y5L0 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
TNPO3Q9Y5L0 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TNPO3Q9Y5L0 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TNPO3Q9Y5L0 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TNPO3Q9Y5L0 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TNPO3Q9Y5L0 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TNPO3Q9Y5L0 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TNPO3Q9Y5L0 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TNPO3Q9Y5L0 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TNPO3Q9Y5L0 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TNPO3Q9Y5L0 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TNPO3Q9Y5L0 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TNPO3Q9Y5L0 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TNPO3Q9Y5L0 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TNPO3Q9Y5L0 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TNPO3Q9Y5L0 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TNPO3Q9Y5L0 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TNPO3Q9Y5L0 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TNPO3Q9Y5L0 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TNPO3Q9Y5L0 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TNPO3Q9Y5L0 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TNPO3Q9Y5L0 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TNPO3Q9Y5L0 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TNPO3Q9Y5L0 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TNPO3Q9Y5L0 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TNPO3Q9Y5L0 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TNPO3Q9Y5L0 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TNPO3Q9Y5L0 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TNPO3Q9Y5L0 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TNPO3Q9Y5L0 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TNPO3Q9Y5L0 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TNPO3Q9Y5L0 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TNPO3Q9Y5L0 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TNPO3Q9Y5L0 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms