Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4D8

HECTD4, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HECTD4, humanhuman

Predictions only

Length 3,996 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECTD4Q9Y4D8 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
HECTD4Q9Y4D8 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
HECTD4Q9Y4D8 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
HECTD4Q9Y4D8 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
HECTD4Q9Y4D8 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
HECTD4Q9Y4D8 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
HECTD4Q9Y4D8 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
HECTD4Q9Y4D8 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
HECTD4Q9Y4D8 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
HECTD4Q9Y4D8 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
HECTD4Q9Y4D8 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
HECTD4Q9Y4D8 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
HECTD4Q9Y4D8 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
HECTD4Q9Y4D8 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
HECTD4Q9Y4D8 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
HECTD4Q9Y4D8 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
HECTD4Q9Y4D8 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
HECTD4Q9Y4D8 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
HECTD4Q9Y4D8 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
HECTD4Q9Y4D8 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
HECTD4Q9Y4D8 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
HECTD4Q9Y4D8 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
HECTD4Q9Y4D8 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
HECTD4Q9Y4D8 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
HECTD4Q9Y4D8 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC14.86□□□□□ -0.03
HECTD4Q9Y4D8 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
HECTD4Q9Y4D8 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
HECTD4Q9Y4D8 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
HECTD4Q9Y4D8 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
HECTD4Q9Y4D8 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
HECTD4Q9Y4D8 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
HECTD4Q9Y4D8 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
HECTD4Q9Y4D8 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
HECTD4Q9Y4D8 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
HECTD4Q9Y4D8 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
HECTD4Q9Y4D8 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
HECTD4Q9Y4D8 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
HECTD4Q9Y4D8 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HECTD4Q9Y4D8 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
HECTD4Q9Y4D8 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
HECTD4Q9Y4D8 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
HECTD4Q9Y4D8 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
HECTD4Q9Y4D8 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
HECTD4Q9Y4D8 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
HECTD4Q9Y4D8 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HECTD4Q9Y4D8 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
HECTD4Q9Y4D8 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
HECTD4Q9Y4D8 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC14.85□□□□□ -0.03
HECTD4Q9Y4D8 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
HECTD4Q9Y4D8 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC14.85□□□□□ -0.03
HECTD4Q9Y4D8 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
HECTD4Q9Y4D8 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
HECTD4Q9Y4D8 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
HECTD4Q9Y4D8 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
HECTD4Q9Y4D8 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HECTD4Q9Y4D8 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HECTD4Q9Y4D8 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
HECTD4Q9Y4D8 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HECTD4Q9Y4D8 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
HECTD4Q9Y4D8 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HECTD4Q9Y4D8 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
HECTD4Q9Y4D8 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
HECTD4Q9Y4D8 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HECTD4Q9Y4D8 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
HECTD4Q9Y4D8 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HECTD4Q9Y4D8 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
HECTD4Q9Y4D8 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HECTD4Q9Y4D8 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HECTD4Q9Y4D8 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
HECTD4Q9Y4D8 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HECTD4Q9Y4D8 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
HECTD4Q9Y4D8 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HECTD4Q9Y4D8 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
HECTD4Q9Y4D8 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
HECTD4Q9Y4D8 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
HECTD4Q9Y4D8 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
HECTD4Q9Y4D8 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
HECTD4Q9Y4D8 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
HECTD4Q9Y4D8 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
HECTD4Q9Y4D8 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
HECTD4Q9Y4D8 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
HECTD4Q9Y4D8 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
HECTD4Q9Y4D8 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
HECTD4Q9Y4D8 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
HECTD4Q9Y4D8 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
HECTD4Q9Y4D8 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
HECTD4Q9Y4D8 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
HECTD4Q9Y4D8 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC14.83□□□□□ -0.04
HECTD4Q9Y4D8 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
HECTD4Q9Y4D8 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
HECTD4Q9Y4D8 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
HECTD4Q9Y4D8 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
HECTD4Q9Y4D8 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
HECTD4Q9Y4D8 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
HECTD4Q9Y4D8 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
HECTD4Q9Y4D8 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
HECTD4Q9Y4D8 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
HECTD4Q9Y4D8 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
HECTD4Q9Y4D8 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
HECTD4Q9Y4D8 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
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