Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2Y8

PRG3, Proteoglycan 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 225 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG3Q9Y2Y8 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
PRG3Q9Y2Y8 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRG3Q9Y2Y8 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
PRG3Q9Y2Y8 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRG3Q9Y2Y8 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRG3Q9Y2Y8 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRG3Q9Y2Y8 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRG3Q9Y2Y8 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRG3Q9Y2Y8 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRG3Q9Y2Y8 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRG3Q9Y2Y8 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRG3Q9Y2Y8 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRG3Q9Y2Y8 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRG3Q9Y2Y8 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
PRG3Q9Y2Y8 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
PRG3Q9Y2Y8 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
PRG3Q9Y2Y8 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
PRG3Q9Y2Y8 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
PRG3Q9Y2Y8 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
PRG3Q9Y2Y8 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
PRG3Q9Y2Y8 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRG3Q9Y2Y8 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRG3Q9Y2Y8 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRG3Q9Y2Y8 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRG3Q9Y2Y8 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRG3Q9Y2Y8 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRG3Q9Y2Y8 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRG3Q9Y2Y8 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRG3Q9Y2Y8 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRG3Q9Y2Y8 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRG3Q9Y2Y8 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRG3Q9Y2Y8 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRG3Q9Y2Y8 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRG3Q9Y2Y8 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRG3Q9Y2Y8 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRG3Q9Y2Y8 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRG3Q9Y2Y8 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRG3Q9Y2Y8 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRG3Q9Y2Y8 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRG3Q9Y2Y8 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRG3Q9Y2Y8 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRG3Q9Y2Y8 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRG3Q9Y2Y8 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
PRG3Q9Y2Y8 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
PRG3Q9Y2Y8 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRG3Q9Y2Y8 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRG3Q9Y2Y8 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRG3Q9Y2Y8 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRG3Q9Y2Y8 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
PRG3Q9Y2Y8 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRG3Q9Y2Y8 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRG3Q9Y2Y8 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRG3Q9Y2Y8 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PRG3Q9Y2Y8 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PRG3Q9Y2Y8 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PRG3Q9Y2Y8 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PRG3Q9Y2Y8 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PRG3Q9Y2Y8 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PRG3Q9Y2Y8 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PRG3Q9Y2Y8 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PRG3Q9Y2Y8 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PRG3Q9Y2Y8 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PRG3Q9Y2Y8 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRG3Q9Y2Y8 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRG3Q9Y2Y8 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRG3Q9Y2Y8 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
PRG3Q9Y2Y8 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRG3Q9Y2Y8 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRG3Q9Y2Y8 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRG3Q9Y2Y8 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRG3Q9Y2Y8 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRG3Q9Y2Y8 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRG3Q9Y2Y8 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRG3Q9Y2Y8 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRG3Q9Y2Y8 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
PRG3Q9Y2Y8 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRG3Q9Y2Y8 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRG3Q9Y2Y8 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
PRG3Q9Y2Y8 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRG3Q9Y2Y8 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRG3Q9Y2Y8 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRG3Q9Y2Y8 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRG3Q9Y2Y8 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
PRG3Q9Y2Y8 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
PRG3Q9Y2Y8 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PRG3Q9Y2Y8 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
PRG3Q9Y2Y8 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
PRG3Q9Y2Y8 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PRG3Q9Y2Y8 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PRG3Q9Y2Y8 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
PRG3Q9Y2Y8 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PRG3Q9Y2Y8 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
PRG3Q9Y2Y8 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PRG3Q9Y2Y8 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PRG3Q9Y2Y8 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PRG3Q9Y2Y8 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PRG3Q9Y2Y8 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRG3Q9Y2Y8 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRG3Q9Y2Y8 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRG3Q9Y2Y8 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms