Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y266

NUDC, Nuclear migration protein nudC, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUDCQ9Y266 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
NUDCQ9Y266 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
NUDCQ9Y266 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC30.15■■■□□ 2.42
NUDCQ9Y266 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
NUDCQ9Y266 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
NUDCQ9Y266 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
NUDCQ9Y266 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC30.14■■■□□ 2.42
NUDCQ9Y266 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
NUDCQ9Y266 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
NUDCQ9Y266 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
NUDCQ9Y266 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
NUDCQ9Y266 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
NUDCQ9Y266 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
NUDCQ9Y266 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
NUDCQ9Y266 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
NUDCQ9Y266 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
NUDCQ9Y266 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
NUDCQ9Y266 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
NUDCQ9Y266 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
NUDCQ9Y266 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
NUDCQ9Y266 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
NUDCQ9Y266 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC30.13■■■□□ 2.41
NUDCQ9Y266 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
NUDCQ9Y266 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
NUDCQ9Y266 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
NUDCQ9Y266 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
NUDCQ9Y266 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
NUDCQ9Y266 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
NUDCQ9Y266 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
NUDCQ9Y266 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
NUDCQ9Y266 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
NUDCQ9Y266 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
NUDCQ9Y266 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
NUDCQ9Y266 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
NUDCQ9Y266 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
NUDCQ9Y266 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
NUDCQ9Y266 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
NUDCQ9Y266 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
NUDCQ9Y266 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
NUDCQ9Y266 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
NUDCQ9Y266 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
NUDCQ9Y266 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
NUDCQ9Y266 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
NUDCQ9Y266 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
NUDCQ9Y266 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
NUDCQ9Y266 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
NUDCQ9Y266 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
NUDCQ9Y266 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
NUDCQ9Y266 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
NUDCQ9Y266 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
NUDCQ9Y266 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
NUDCQ9Y266 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
NUDCQ9Y266 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
NUDCQ9Y266 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
NUDCQ9Y266 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
NUDCQ9Y266 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
NUDCQ9Y266 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
NUDCQ9Y266 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
NUDCQ9Y266 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
NUDCQ9Y266 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
NUDCQ9Y266 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
NUDCQ9Y266 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
NUDCQ9Y266 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
NUDCQ9Y266 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
NUDCQ9Y266 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
NUDCQ9Y266 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
NUDCQ9Y266 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
NUDCQ9Y266 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
NUDCQ9Y266 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
NUDCQ9Y266 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.41
NUDCQ9Y266 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.41
NUDCQ9Y266 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC30.07■■■□□ 2.41
NUDCQ9Y266 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
NUDCQ9Y266 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
NUDCQ9Y266 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
NUDCQ9Y266 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
NUDCQ9Y266 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
NUDCQ9Y266 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
NUDCQ9Y266 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
NUDCQ9Y266 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
NUDCQ9Y266 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
NUDCQ9Y266 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
NUDCQ9Y266 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC30.06■■■□□ 2.4
NUDCQ9Y266 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
NUDCQ9Y266 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
NUDCQ9Y266 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
NUDCQ9Y266 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
NUDCQ9Y266 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
NUDCQ9Y266 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
NUDCQ9Y266 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
NUDCQ9Y266 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
NUDCQ9Y266 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
NUDCQ9Y266 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
NUDCQ9Y266 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
NUDCQ9Y266 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
NUDCQ9Y266 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC30.04■■■□□ 2.4
NUDCQ9Y266 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
NUDCQ9Y266 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
NUDCQ9Y266 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
NUDCQ9Y266 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms