Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y262

EIF3L, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit L, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 564 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF3LQ9Y262 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
EIF3LQ9Y262 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
EIF3LQ9Y262 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
EIF3LQ9Y262 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
EIF3LQ9Y262 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
EIF3LQ9Y262 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
EIF3LQ9Y262 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
EIF3LQ9Y262 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
EIF3LQ9Y262 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
EIF3LQ9Y262 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
EIF3LQ9Y262 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
EIF3LQ9Y262 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
EIF3LQ9Y262 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
EIF3LQ9Y262 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
EIF3LQ9Y262 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
EIF3LQ9Y262 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
EIF3LQ9Y262 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
EIF3LQ9Y262 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
EIF3LQ9Y262 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
EIF3LQ9Y262 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
EIF3LQ9Y262 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
EIF3LQ9Y262 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
EIF3LQ9Y262 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
EIF3LQ9Y262 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
EIF3LQ9Y262 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
EIF3LQ9Y262 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
EIF3LQ9Y262 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
EIF3LQ9Y262 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
EIF3LQ9Y262 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
EIF3LQ9Y262 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
EIF3LQ9Y262 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
EIF3LQ9Y262 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
EIF3LQ9Y262 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
EIF3LQ9Y262 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
EIF3LQ9Y262 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
EIF3LQ9Y262 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
EIF3LQ9Y262 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
EIF3LQ9Y262 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EIF3LQ9Y262 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EIF3LQ9Y262 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
EIF3LQ9Y262 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
EIF3LQ9Y262 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EIF3LQ9Y262 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EIF3LQ9Y262 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EIF3LQ9Y262 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
EIF3LQ9Y262 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
EIF3LQ9Y262 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
EIF3LQ9Y262 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
EIF3LQ9Y262 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
EIF3LQ9Y262 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
EIF3LQ9Y262 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
EIF3LQ9Y262 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
EIF3LQ9Y262 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
EIF3LQ9Y262 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
EIF3LQ9Y262 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
EIF3LQ9Y262 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
EIF3LQ9Y262 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
EIF3LQ9Y262 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
EIF3LQ9Y262 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
EIF3LQ9Y262 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
EIF3LQ9Y262 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EIF3LQ9Y262 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EIF3LQ9Y262 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EIF3LQ9Y262 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EIF3LQ9Y262 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EIF3LQ9Y262 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EIF3LQ9Y262 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EIF3LQ9Y262 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EIF3LQ9Y262 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EIF3LQ9Y262 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EIF3LQ9Y262 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EIF3LQ9Y262 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EIF3LQ9Y262 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EIF3LQ9Y262 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EIF3LQ9Y262 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EIF3LQ9Y262 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EIF3LQ9Y262 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EIF3LQ9Y262 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
EIF3LQ9Y262 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EIF3LQ9Y262 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
EIF3LQ9Y262 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EIF3LQ9Y262 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EIF3LQ9Y262 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
EIF3LQ9Y262 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
EIF3LQ9Y262 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EIF3LQ9Y262 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EIF3LQ9Y262 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EIF3LQ9Y262 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
EIF3LQ9Y262 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
EIF3LQ9Y262 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
EIF3LQ9Y262 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
EIF3LQ9Y262 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EIF3LQ9Y262 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
EIF3LQ9Y262 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EIF3LQ9Y262 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EIF3LQ9Y262 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
EIF3LQ9Y262 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EIF3LQ9Y262 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
EIF3LQ9Y262 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
EIF3LQ9Y262 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms