Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y248

GINS2, DNA replication complex GINS protein PSF2, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS2Q9Y248 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GINS2Q9Y248 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GINS2Q9Y248 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GINS2Q9Y248 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GINS2Q9Y248 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GINS2Q9Y248 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GINS2Q9Y248 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GINS2Q9Y248 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GINS2Q9Y248 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GINS2Q9Y248 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GINS2Q9Y248 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GINS2Q9Y248 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GINS2Q9Y248 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GINS2Q9Y248 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GINS2Q9Y248 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GINS2Q9Y248 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GINS2Q9Y248 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GINS2Q9Y248 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GINS2Q9Y248 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GINS2Q9Y248 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GINS2Q9Y248 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GINS2Q9Y248 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GINS2Q9Y248 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GINS2Q9Y248 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GINS2Q9Y248 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GINS2Q9Y248 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GINS2Q9Y248 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
GINS2Q9Y248 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GINS2Q9Y248 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
GINS2Q9Y248 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
GINS2Q9Y248 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GINS2Q9Y248 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GINS2Q9Y248 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GINS2Q9Y248 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GINS2Q9Y248 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
GINS2Q9Y248 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GINS2Q9Y248 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GINS2Q9Y248 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
GINS2Q9Y248 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GINS2Q9Y248 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GINS2Q9Y248 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GINS2Q9Y248 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
GINS2Q9Y248 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GINS2Q9Y248 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GINS2Q9Y248 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GINS2Q9Y248 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GINS2Q9Y248 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
GINS2Q9Y248 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
GINS2Q9Y248 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
GINS2Q9Y248 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GINS2Q9Y248 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GINS2Q9Y248 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GINS2Q9Y248 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GINS2Q9Y248 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
GINS2Q9Y248 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
GINS2Q9Y248 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
GINS2Q9Y248 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GINS2Q9Y248 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GINS2Q9Y248 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GINS2Q9Y248 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GINS2Q9Y248 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GINS2Q9Y248 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GINS2Q9Y248 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GINS2Q9Y248 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GINS2Q9Y248 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GINS2Q9Y248 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GINS2Q9Y248 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
GINS2Q9Y248 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GINS2Q9Y248 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GINS2Q9Y248 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GINS2Q9Y248 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GINS2Q9Y248 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GINS2Q9Y248 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GINS2Q9Y248 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GINS2Q9Y248 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GINS2Q9Y248 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GINS2Q9Y248 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GINS2Q9Y248 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GINS2Q9Y248 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GINS2Q9Y248 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GINS2Q9Y248 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GINS2Q9Y248 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GINS2Q9Y248 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
GINS2Q9Y248 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GINS2Q9Y248 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GINS2Q9Y248 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GINS2Q9Y248 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GINS2Q9Y248 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GINS2Q9Y248 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GINS2Q9Y248 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GINS2Q9Y248 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GINS2Q9Y248 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GINS2Q9Y248 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GINS2Q9Y248 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GINS2Q9Y248 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GINS2Q9Y248 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GINS2Q9Y248 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GINS2Q9Y248 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GINS2Q9Y248 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GINS2Q9Y248 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms