Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQP3

TNN, Tenascin-N, humanhuman

Predictions only

Length 1,299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNQ9UQP3 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
TNNQ9UQP3 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
TNNQ9UQP3 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
TNNQ9UQP3 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
TNNQ9UQP3 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
TNNQ9UQP3 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
TNNQ9UQP3 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
TNNQ9UQP3 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TNNQ9UQP3 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TNNQ9UQP3 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TNNQ9UQP3 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TNNQ9UQP3 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TNNQ9UQP3 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TNNQ9UQP3 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TNNQ9UQP3 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TNNQ9UQP3 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TNNQ9UQP3 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
TNNQ9UQP3 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TNNQ9UQP3 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
TNNQ9UQP3 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TNNQ9UQP3 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
TNNQ9UQP3 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
TNNQ9UQP3 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TNNQ9UQP3 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TNNQ9UQP3 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TNNQ9UQP3 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
TNNQ9UQP3 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
TNNQ9UQP3 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
TNNQ9UQP3 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
TNNQ9UQP3 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
TNNQ9UQP3 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
TNNQ9UQP3 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
TNNQ9UQP3 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
TNNQ9UQP3 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
TNNQ9UQP3 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
TNNQ9UQP3 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
TNNQ9UQP3 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
TNNQ9UQP3 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
TNNQ9UQP3 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
TNNQ9UQP3 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
TNNQ9UQP3 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
TNNQ9UQP3 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
TNNQ9UQP3 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
TNNQ9UQP3 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
TNNQ9UQP3 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
TNNQ9UQP3 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
TNNQ9UQP3 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
TNNQ9UQP3 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
TNNQ9UQP3 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
TNNQ9UQP3 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
TNNQ9UQP3 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
TNNQ9UQP3 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
TNNQ9UQP3 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TNNQ9UQP3 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
TNNQ9UQP3 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC28.43■■■□□ 2.14
TNNQ9UQP3 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
TNNQ9UQP3 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TNNQ9UQP3 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
TNNQ9UQP3 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TNNQ9UQP3 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TNNQ9UQP3 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
TNNQ9UQP3 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TNNQ9UQP3 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TNNQ9UQP3 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TNNQ9UQP3 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
TNNQ9UQP3 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
TNNQ9UQP3 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TNNQ9UQP3 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TNNQ9UQP3 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TNNQ9UQP3 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
TNNQ9UQP3 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TNNQ9UQP3 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC28.41■■■□□ 2.14
TNNQ9UQP3 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
TNNQ9UQP3 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
TNNQ9UQP3 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TNNQ9UQP3 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TNNQ9UQP3 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TNNQ9UQP3 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TNNQ9UQP3 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
TNNQ9UQP3 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
TNNQ9UQP3 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
TNNQ9UQP3 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TNNQ9UQP3 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
TNNQ9UQP3 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
TNNQ9UQP3 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
TNNQ9UQP3 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
TNNQ9UQP3 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
TNNQ9UQP3 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
TNNQ9UQP3 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TNNQ9UQP3 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
TNNQ9UQP3 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
TNNQ9UQP3 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
TNNQ9UQP3 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
TNNQ9UQP3 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
TNNQ9UQP3 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
TNNQ9UQP3 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
TNNQ9UQP3 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
TNNQ9UQP3 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
TNNQ9UQP3 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TNNQ9UQP3 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms