Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPX8

SHANK2, SH3 and multiple ankyrin repeat domains protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHANK2Q9UPX8 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC33.66■■■□□ 2.98
SHANK2Q9UPX8 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
SHANK2Q9UPX8 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC33.66■■■□□ 2.98
SHANK2Q9UPX8 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
SHANK2Q9UPX8 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
SHANK2Q9UPX8 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.65■■■□□ 2.98
SHANK2Q9UPX8 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.65■■■□□ 2.98
SHANK2Q9UPX8 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.65■■■□□ 2.98
SHANK2Q9UPX8 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC33.65■■■□□ 2.98
SHANK2Q9UPX8 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
SHANK2Q9UPX8 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC33.65■■■□□ 2.98
SHANK2Q9UPX8 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.65■■■□□ 2.98
SHANK2Q9UPX8 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
SHANK2Q9UPX8 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
SHANK2Q9UPX8 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.98
SHANK2Q9UPX8 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC33.64■■■□□ 2.98
SHANK2Q9UPX8 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC33.64■■■□□ 2.98
SHANK2Q9UPX8 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC33.64■■■□□ 2.98
SHANK2Q9UPX8 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
SHANK2Q9UPX8 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
SHANK2Q9UPX8 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
SHANK2Q9UPX8 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
SHANK2Q9UPX8 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
SHANK2Q9UPX8 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.63■■■□□ 2.97
SHANK2Q9UPX8 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC33.63■■■□□ 2.97
SHANK2Q9UPX8 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
SHANK2Q9UPX8 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC33.62■■■□□ 2.97
SHANK2Q9UPX8 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
SHANK2Q9UPX8 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
SHANK2Q9UPX8 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.61■■■□□ 2.97
SHANK2Q9UPX8 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC33.61■■■□□ 2.97
SHANK2Q9UPX8 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC33.61■■■□□ 2.97
SHANK2Q9UPX8 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.61■■■□□ 2.97
SHANK2Q9UPX8 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC33.61■■■□□ 2.97
SHANK2Q9UPX8 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC33.61■■■□□ 2.97
SHANK2Q9UPX8 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC33.61■■■□□ 2.97
SHANK2Q9UPX8 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
SHANK2Q9UPX8 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
SHANK2Q9UPX8 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
SHANK2Q9UPX8 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
SHANK2Q9UPX8 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC33.6■■■□□ 2.97
SHANK2Q9UPX8 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC33.6■■■□□ 2.97
SHANK2Q9UPX8 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC33.6■■■□□ 2.97
SHANK2Q9UPX8 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
SHANK2Q9UPX8 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC33.6■■■□□ 2.97
SHANK2Q9UPX8 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
SHANK2Q9UPX8 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
SHANK2Q9UPX8 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
SHANK2Q9UPX8 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
SHANK2Q9UPX8 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
SHANK2Q9UPX8 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
SHANK2Q9UPX8 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
SHANK2Q9UPX8 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC33.59■■■□□ 2.97
SHANK2Q9UPX8 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC33.59■■■□□ 2.97
SHANK2Q9UPX8 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC33.59■■■□□ 2.97
SHANK2Q9UPX8 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.59■■■□□ 2.97
SHANK2Q9UPX8 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
SHANK2Q9UPX8 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
SHANK2Q9UPX8 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
SHANK2Q9UPX8 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
SHANK2Q9UPX8 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
SHANK2Q9UPX8 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
SHANK2Q9UPX8 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC33.58■■■□□ 2.97
SHANK2Q9UPX8 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC33.58■■■□□ 2.97
SHANK2Q9UPX8 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC33.58■■■□□ 2.97
SHANK2Q9UPX8 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
SHANK2Q9UPX8 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC33.58■■■□□ 2.97
SHANK2Q9UPX8 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC33.58■■■□□ 2.97
SHANK2Q9UPX8 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.57■■■□□ 2.97
SHANK2Q9UPX8 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.57■■■□□ 2.97
SHANK2Q9UPX8 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC33.57■■■□□ 2.97
SHANK2Q9UPX8 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.97
SHANK2Q9UPX8 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC33.57■■■□□ 2.97
SHANK2Q9UPX8 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
SHANK2Q9UPX8 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
SHANK2Q9UPX8 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
SHANK2Q9UPX8 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.56■■■□□ 2.96
SHANK2Q9UPX8 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC33.56■■■□□ 2.96
SHANK2Q9UPX8 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
SHANK2Q9UPX8 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
SHANK2Q9UPX8 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC33.56■■■□□ 2.96
SHANK2Q9UPX8 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC33.56■■■□□ 2.96
SHANK2Q9UPX8 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.56■■■□□ 2.96
SHANK2Q9UPX8 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
SHANK2Q9UPX8 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC33.56■■■□□ 2.96
SHANK2Q9UPX8 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
SHANK2Q9UPX8 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
SHANK2Q9UPX8 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
SHANK2Q9UPX8 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
SHANK2Q9UPX8 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC33.55■■■□□ 2.96
SHANK2Q9UPX8 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC33.55■■■□□ 2.96
SHANK2Q9UPX8 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC33.55■■■□□ 2.96
SHANK2Q9UPX8 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
SHANK2Q9UPX8 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC33.55■■■□□ 2.96
SHANK2Q9UPX8 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
SHANK2Q9UPX8 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
SHANK2Q9UPX8 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
SHANK2Q9UPX8 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
SHANK2Q9UPX8 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
SHANK2Q9UPX8 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 122.6 ms