Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPX6

KIAA1024, UPF0258 protein KIAA1024, humanhuman

Predictions only

Length 916 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA1024Q9UPX6 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
KIAA1024Q9UPX6 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
KIAA1024Q9UPX6 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
KIAA1024Q9UPX6 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
KIAA1024Q9UPX6 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
KIAA1024Q9UPX6 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
KIAA1024Q9UPX6 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
KIAA1024Q9UPX6 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
KIAA1024Q9UPX6 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
KIAA1024Q9UPX6 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
KIAA1024Q9UPX6 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
KIAA1024Q9UPX6 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
KIAA1024Q9UPX6 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
KIAA1024Q9UPX6 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
KIAA1024Q9UPX6 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
KIAA1024Q9UPX6 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
KIAA1024Q9UPX6 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KIAA1024Q9UPX6 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KIAA1024Q9UPX6 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
KIAA1024Q9UPX6 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KIAA1024Q9UPX6 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
KIAA1024Q9UPX6 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KIAA1024Q9UPX6 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
KIAA1024Q9UPX6 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KIAA1024Q9UPX6 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
KIAA1024Q9UPX6 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KIAA1024Q9UPX6 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
KIAA1024Q9UPX6 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KIAA1024Q9UPX6 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KIAA1024Q9UPX6 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KIAA1024Q9UPX6 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
KIAA1024Q9UPX6 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KIAA1024Q9UPX6 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
KIAA1024Q9UPX6 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
KIAA1024Q9UPX6 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
KIAA1024Q9UPX6 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
KIAA1024Q9UPX6 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
KIAA1024Q9UPX6 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
KIAA1024Q9UPX6 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
KIAA1024Q9UPX6 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
KIAA1024Q9UPX6 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
KIAA1024Q9UPX6 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
KIAA1024Q9UPX6 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
KIAA1024Q9UPX6 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
KIAA1024Q9UPX6 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
KIAA1024Q9UPX6 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
KIAA1024Q9UPX6 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
KIAA1024Q9UPX6 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
KIAA1024Q9UPX6 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
KIAA1024Q9UPX6 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
KIAA1024Q9UPX6 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
KIAA1024Q9UPX6 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
KIAA1024Q9UPX6 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
KIAA1024Q9UPX6 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
KIAA1024Q9UPX6 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
KIAA1024Q9UPX6 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
KIAA1024Q9UPX6 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
KIAA1024Q9UPX6 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
KIAA1024Q9UPX6 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
KIAA1024Q9UPX6 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
KIAA1024Q9UPX6 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
KIAA1024Q9UPX6 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
KIAA1024Q9UPX6 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
KIAA1024Q9UPX6 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
KIAA1024Q9UPX6 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
KIAA1024Q9UPX6 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
KIAA1024Q9UPX6 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KIAA1024Q9UPX6 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
KIAA1024Q9UPX6 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
KIAA1024Q9UPX6 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KIAA1024Q9UPX6 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KIAA1024Q9UPX6 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
KIAA1024Q9UPX6 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
KIAA1024Q9UPX6 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
KIAA1024Q9UPX6 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
KIAA1024Q9UPX6 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
KIAA1024Q9UPX6 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
KIAA1024Q9UPX6 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
KIAA1024Q9UPX6 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
KIAA1024Q9UPX6 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
KIAA1024Q9UPX6 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
KIAA1024Q9UPX6 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
KIAA1024Q9UPX6 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
KIAA1024Q9UPX6 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
KIAA1024Q9UPX6 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
KIAA1024Q9UPX6 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
KIAA1024Q9UPX6 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
KIAA1024Q9UPX6 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
KIAA1024Q9UPX6 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
KIAA1024Q9UPX6 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
KIAA1024Q9UPX6 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
KIAA1024Q9UPX6 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
KIAA1024Q9UPX6 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
KIAA1024Q9UPX6 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
KIAA1024Q9UPX6 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
KIAA1024Q9UPX6 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
KIAA1024Q9UPX6 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
KIAA1024Q9UPX6 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
KIAA1024Q9UPX6 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
KIAA1024Q9UPX6 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.9 ms