Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPE1

SRPK3, SRSF protein kinase 3, humanhuman

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Length 567 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRPK3Q9UPE1 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SRPK3Q9UPE1 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SRPK3Q9UPE1 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SRPK3Q9UPE1 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SRPK3Q9UPE1 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SRPK3Q9UPE1 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SRPK3Q9UPE1 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SRPK3Q9UPE1 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SRPK3Q9UPE1 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SRPK3Q9UPE1 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SRPK3Q9UPE1 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SRPK3Q9UPE1 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SRPK3Q9UPE1 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
SRPK3Q9UPE1 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SRPK3Q9UPE1 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SRPK3Q9UPE1 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SRPK3Q9UPE1 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SRPK3Q9UPE1 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SRPK3Q9UPE1 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SRPK3Q9UPE1 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SRPK3Q9UPE1 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SRPK3Q9UPE1 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SRPK3Q9UPE1 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SRPK3Q9UPE1 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SRPK3Q9UPE1 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
SRPK3Q9UPE1 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
SRPK3Q9UPE1 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
SRPK3Q9UPE1 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SRPK3Q9UPE1 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SRPK3Q9UPE1 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
SRPK3Q9UPE1 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SRPK3Q9UPE1 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SRPK3Q9UPE1 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SRPK3Q9UPE1 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SRPK3Q9UPE1 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SRPK3Q9UPE1 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SRPK3Q9UPE1 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SRPK3Q9UPE1 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SRPK3Q9UPE1 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SRPK3Q9UPE1 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SRPK3Q9UPE1 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SRPK3Q9UPE1 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SRPK3Q9UPE1 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SRPK3Q9UPE1 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SRPK3Q9UPE1 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SRPK3Q9UPE1 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SRPK3Q9UPE1 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SRPK3Q9UPE1 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SRPK3Q9UPE1 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SRPK3Q9UPE1 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SRPK3Q9UPE1 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SRPK3Q9UPE1 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SRPK3Q9UPE1 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SRPK3Q9UPE1 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SRPK3Q9UPE1 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SRPK3Q9UPE1 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SRPK3Q9UPE1 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SRPK3Q9UPE1 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SRPK3Q9UPE1 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SRPK3Q9UPE1 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SRPK3Q9UPE1 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SRPK3Q9UPE1 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SRPK3Q9UPE1 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
SRPK3Q9UPE1 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SRPK3Q9UPE1 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SRPK3Q9UPE1 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SRPK3Q9UPE1 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SRPK3Q9UPE1 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SRPK3Q9UPE1 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SRPK3Q9UPE1 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SRPK3Q9UPE1 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SRPK3Q9UPE1 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SRPK3Q9UPE1 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SRPK3Q9UPE1 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SRPK3Q9UPE1 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SRPK3Q9UPE1 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SRPK3Q9UPE1 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
SRPK3Q9UPE1 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SRPK3Q9UPE1 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SRPK3Q9UPE1 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SRPK3Q9UPE1 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SRPK3Q9UPE1 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SRPK3Q9UPE1 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SRPK3Q9UPE1 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SRPK3Q9UPE1 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SRPK3Q9UPE1 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SRPK3Q9UPE1 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SRPK3Q9UPE1 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SRPK3Q9UPE1 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SRPK3Q9UPE1 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SRPK3Q9UPE1 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SRPK3Q9UPE1 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SRPK3Q9UPE1 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SRPK3Q9UPE1 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SRPK3Q9UPE1 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SRPK3Q9UPE1 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SRPK3Q9UPE1 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SRPK3Q9UPE1 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SRPK3Q9UPE1 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SRPK3Q9UPE1 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
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