Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMR3

TBX20, T-box transcription factor TBX20, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBX20Q9UMR3 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TBX20Q9UMR3 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TBX20Q9UMR3 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
TBX20Q9UMR3 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TBX20Q9UMR3 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TBX20Q9UMR3 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TBX20Q9UMR3 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TBX20Q9UMR3 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TBX20Q9UMR3 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TBX20Q9UMR3 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TBX20Q9UMR3 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TBX20Q9UMR3 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TBX20Q9UMR3 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TBX20Q9UMR3 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TBX20Q9UMR3 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TBX20Q9UMR3 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TBX20Q9UMR3 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TBX20Q9UMR3 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
TBX20Q9UMR3 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
TBX20Q9UMR3 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TBX20Q9UMR3 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TBX20Q9UMR3 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
TBX20Q9UMR3 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TBX20Q9UMR3 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TBX20Q9UMR3 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TBX20Q9UMR3 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
TBX20Q9UMR3 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TBX20Q9UMR3 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
TBX20Q9UMR3 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TBX20Q9UMR3 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TBX20Q9UMR3 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
TBX20Q9UMR3 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TBX20Q9UMR3 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
TBX20Q9UMR3 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TBX20Q9UMR3 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
TBX20Q9UMR3 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
TBX20Q9UMR3 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
TBX20Q9UMR3 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
TBX20Q9UMR3 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
TBX20Q9UMR3 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TBX20Q9UMR3 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TBX20Q9UMR3 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TBX20Q9UMR3 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TBX20Q9UMR3 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
TBX20Q9UMR3 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TBX20Q9UMR3 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TBX20Q9UMR3 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TBX20Q9UMR3 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TBX20Q9UMR3 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TBX20Q9UMR3 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TBX20Q9UMR3 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
TBX20Q9UMR3 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
TBX20Q9UMR3 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
TBX20Q9UMR3 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.51
TBX20Q9UMR3 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
TBX20Q9UMR3 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TBX20Q9UMR3 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TBX20Q9UMR3 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TBX20Q9UMR3 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TBX20Q9UMR3 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TBX20Q9UMR3 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TBX20Q9UMR3 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TBX20Q9UMR3 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TBX20Q9UMR3 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TBX20Q9UMR3 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TBX20Q9UMR3 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TBX20Q9UMR3 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TBX20Q9UMR3 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TBX20Q9UMR3 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
TBX20Q9UMR3 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TBX20Q9UMR3 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
TBX20Q9UMR3 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TBX20Q9UMR3 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TBX20Q9UMR3 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TBX20Q9UMR3 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TBX20Q9UMR3 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TBX20Q9UMR3 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TBX20Q9UMR3 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TBX20Q9UMR3 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TBX20Q9UMR3 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TBX20Q9UMR3 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TBX20Q9UMR3 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TBX20Q9UMR3 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TBX20Q9UMR3 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TBX20Q9UMR3 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TBX20Q9UMR3 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TBX20Q9UMR3 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TBX20Q9UMR3 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TBX20Q9UMR3 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TBX20Q9UMR3 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TBX20Q9UMR3 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TBX20Q9UMR3 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TBX20Q9UMR3 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
TBX20Q9UMR3 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TBX20Q9UMR3 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TBX20Q9UMR3 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TBX20Q9UMR3 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TBX20Q9UMR3 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TBX20Q9UMR3 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TBX20Q9UMR3 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms