Protein–RNA interactions for Protein: Q9UM22

EPDR1, Mammalian ependymin-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPDR1Q9UM22 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
EPDR1Q9UM22 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
EPDR1Q9UM22 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
EPDR1Q9UM22 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
EPDR1Q9UM22 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
EPDR1Q9UM22 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
EPDR1Q9UM22 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
EPDR1Q9UM22 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
EPDR1Q9UM22 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
EPDR1Q9UM22 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
EPDR1Q9UM22 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
EPDR1Q9UM22 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
EPDR1Q9UM22 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
EPDR1Q9UM22 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
EPDR1Q9UM22 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
EPDR1Q9UM22 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
EPDR1Q9UM22 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
EPDR1Q9UM22 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
EPDR1Q9UM22 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
EPDR1Q9UM22 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
EPDR1Q9UM22 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
EPDR1Q9UM22 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
EPDR1Q9UM22 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
EPDR1Q9UM22 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
EPDR1Q9UM22 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
EPDR1Q9UM22 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
EPDR1Q9UM22 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
EPDR1Q9UM22 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
EPDR1Q9UM22 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
EPDR1Q9UM22 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
EPDR1Q9UM22 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
EPDR1Q9UM22 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
EPDR1Q9UM22 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
EPDR1Q9UM22 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
EPDR1Q9UM22 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
EPDR1Q9UM22 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
EPDR1Q9UM22 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
EPDR1Q9UM22 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
EPDR1Q9UM22 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
EPDR1Q9UM22 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
EPDR1Q9UM22 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
EPDR1Q9UM22 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
EPDR1Q9UM22 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
EPDR1Q9UM22 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
EPDR1Q9UM22 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
EPDR1Q9UM22 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
EPDR1Q9UM22 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
EPDR1Q9UM22 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
EPDR1Q9UM22 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
EPDR1Q9UM22 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
EPDR1Q9UM22 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
EPDR1Q9UM22 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
EPDR1Q9UM22 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
EPDR1Q9UM22 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
EPDR1Q9UM22 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
EPDR1Q9UM22 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
EPDR1Q9UM22 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
EPDR1Q9UM22 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
EPDR1Q9UM22 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
EPDR1Q9UM22 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
EPDR1Q9UM22 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
EPDR1Q9UM22 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
EPDR1Q9UM22 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
EPDR1Q9UM22 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
EPDR1Q9UM22 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
EPDR1Q9UM22 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
EPDR1Q9UM22 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
EPDR1Q9UM22 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
EPDR1Q9UM22 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
EPDR1Q9UM22 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
EPDR1Q9UM22 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
EPDR1Q9UM22 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
EPDR1Q9UM22 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EPDR1Q9UM22 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EPDR1Q9UM22 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EPDR1Q9UM22 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EPDR1Q9UM22 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC17■□□□□ 0.31
EPDR1Q9UM22 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EPDR1Q9UM22 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EPDR1Q9UM22 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
EPDR1Q9UM22 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EPDR1Q9UM22 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
EPDR1Q9UM22 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EPDR1Q9UM22 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EPDR1Q9UM22 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EPDR1Q9UM22 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EPDR1Q9UM22 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EPDR1Q9UM22 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EPDR1Q9UM22 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EPDR1Q9UM22 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EPDR1Q9UM22 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EPDR1Q9UM22 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EPDR1Q9UM22 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EPDR1Q9UM22 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EPDR1Q9UM22 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EPDR1Q9UM22 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
EPDR1Q9UM22 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EPDR1Q9UM22 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EPDR1Q9UM22 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EPDR1Q9UM22 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms