Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULD9

ZNF608, Zinc finger protein 608, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,512 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF608Q9ULD9 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
ZNF608Q9ULD9 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC37.66■■■■□ 3.62
ZNF608Q9ULD9 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
ZNF608Q9ULD9 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
ZNF608Q9ULD9 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.65■■■■□ 3.62
ZNF608Q9ULD9 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
ZNF608Q9ULD9 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
ZNF608Q9ULD9 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
ZNF608Q9ULD9 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
ZNF608Q9ULD9 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
ZNF608Q9ULD9 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC37.64■■■■□ 3.62
ZNF608Q9ULD9 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC37.64■■■■□ 3.62
ZNF608Q9ULD9 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
ZNF608Q9ULD9 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC37.64■■■■□ 3.62
ZNF608Q9ULD9 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
ZNF608Q9ULD9 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
ZNF608Q9ULD9 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
ZNF608Q9ULD9 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
ZNF608Q9ULD9 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
ZNF608Q9ULD9 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC37.63■■■■□ 3.61
ZNF608Q9ULD9 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
ZNF608Q9ULD9 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC37.62■■■■□ 3.61
ZNF608Q9ULD9 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC37.62■■■■□ 3.61
ZNF608Q9ULD9 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC37.62■■■■□ 3.61
ZNF608Q9ULD9 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
ZNF608Q9ULD9 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
ZNF608Q9ULD9 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC37.61■■■■□ 3.61
ZNF608Q9ULD9 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC37.61■■■■□ 3.61
ZNF608Q9ULD9 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
ZNF608Q9ULD9 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC37.61■■■■□ 3.61
ZNF608Q9ULD9 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC37.61■■■■□ 3.61
ZNF608Q9ULD9 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
ZNF608Q9ULD9 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
ZNF608Q9ULD9 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
ZNF608Q9ULD9 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
ZNF608Q9ULD9 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC37.6■■■■□ 3.61
ZNF608Q9ULD9 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC37.6■■■■□ 3.61
ZNF608Q9ULD9 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC37.6■■■■□ 3.61
ZNF608Q9ULD9 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC37.6■■■■□ 3.61
ZNF608Q9ULD9 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
ZNF608Q9ULD9 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
ZNF608Q9ULD9 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC37.6■■■■□ 3.61
ZNF608Q9ULD9 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
ZNF608Q9ULD9 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC37.59■■■■□ 3.61
ZNF608Q9ULD9 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC37.59■■■■□ 3.61
ZNF608Q9ULD9 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
ZNF608Q9ULD9 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
ZNF608Q9ULD9 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC37.58■■■■□ 3.61
ZNF608Q9ULD9 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC37.58■■■■□ 3.61
ZNF608Q9ULD9 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
ZNF608Q9ULD9 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC37.57■■■■□ 3.61
ZNF608Q9ULD9 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.6
ZNF608Q9ULD9 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.6
ZNF608Q9ULD9 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
ZNF608Q9ULD9 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
ZNF608Q9ULD9 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC37.56■■■■□ 3.6
ZNF608Q9ULD9 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
ZNF608Q9ULD9 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
ZNF608Q9ULD9 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC37.56■■■■□ 3.6
ZNF608Q9ULD9 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC37.56■■■■□ 3.6
ZNF608Q9ULD9 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
ZNF608Q9ULD9 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
ZNF608Q9ULD9 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC37.56■■■■□ 3.6
ZNF608Q9ULD9 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
ZNF608Q9ULD9 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC37.56■■■■□ 3.6
ZNF608Q9ULD9 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC37.56■■■■□ 3.6
ZNF608Q9ULD9 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
ZNF608Q9ULD9 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC37.55■■■■□ 3.6
ZNF608Q9ULD9 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
ZNF608Q9ULD9 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.55■■■■□ 3.6
ZNF608Q9ULD9 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC37.55■■■■□ 3.6
ZNF608Q9ULD9 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC37.55■■■■□ 3.6
ZNF608Q9ULD9 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC37.55■■■■□ 3.6
ZNF608Q9ULD9 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
ZNF608Q9ULD9 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC37.54■■■■□ 3.6
ZNF608Q9ULD9 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
ZNF608Q9ULD9 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
ZNF608Q9ULD9 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC37.54■■■■□ 3.6
ZNF608Q9ULD9 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC37.54■■■■□ 3.6
ZNF608Q9ULD9 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC37.54■■■■□ 3.6
ZNF608Q9ULD9 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC37.53■■■■□ 3.6
ZNF608Q9ULD9 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC37.53■■■■□ 3.6
ZNF608Q9ULD9 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC37.53■■■■□ 3.6
ZNF608Q9ULD9 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC37.53■■■■□ 3.6
ZNF608Q9ULD9 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
ZNF608Q9ULD9 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
ZNF608Q9ULD9 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
ZNF608Q9ULD9 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
ZNF608Q9ULD9 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC37.52■■■■□ 3.6
ZNF608Q9ULD9 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC37.52■■■■□ 3.6
ZNF608Q9ULD9 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC37.52■■■■□ 3.6
ZNF608Q9ULD9 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.52■■■■□ 3.6
ZNF608Q9ULD9 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
ZNF608Q9ULD9 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC37.51■■■■□ 3.6
ZNF608Q9ULD9 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.6
ZNF608Q9ULD9 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC37.51■■■■□ 3.6
ZNF608Q9ULD9 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC37.51■■■■□ 3.6
ZNF608Q9ULD9 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC37.51■■■■□ 3.6
ZNF608Q9ULD9 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC37.51■■■■□ 3.6
ZNF608Q9ULD9 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC37.51■■■■□ 3.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.1 ms