Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULB4

CDH9, Cadherin-9, humanhuman

Predictions only

Length 789 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH9Q9ULB4 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDH9Q9ULB4 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CDH9Q9ULB4 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDH9Q9ULB4 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CDH9Q9ULB4 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CDH9Q9ULB4 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CDH9Q9ULB4 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CDH9Q9ULB4 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CDH9Q9ULB4 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CDH9Q9ULB4 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CDH9Q9ULB4 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDH9Q9ULB4 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDH9Q9ULB4 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDH9Q9ULB4 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDH9Q9ULB4 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDH9Q9ULB4 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDH9Q9ULB4 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDH9Q9ULB4 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDH9Q9ULB4 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDH9Q9ULB4 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CDH9Q9ULB4 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDH9Q9ULB4 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDH9Q9ULB4 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDH9Q9ULB4 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CDH9Q9ULB4 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CDH9Q9ULB4 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CDH9Q9ULB4 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CDH9Q9ULB4 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CDH9Q9ULB4 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CDH9Q9ULB4 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CDH9Q9ULB4 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CDH9Q9ULB4 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDH9Q9ULB4 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDH9Q9ULB4 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDH9Q9ULB4 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CDH9Q9ULB4 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDH9Q9ULB4 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDH9Q9ULB4 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDH9Q9ULB4 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDH9Q9ULB4 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDH9Q9ULB4 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDH9Q9ULB4 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDH9Q9ULB4 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CDH9Q9ULB4 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDH9Q9ULB4 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDH9Q9ULB4 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDH9Q9ULB4 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDH9Q9ULB4 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CDH9Q9ULB4 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CDH9Q9ULB4 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CDH9Q9ULB4 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
CDH9Q9ULB4 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CDH9Q9ULB4 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CDH9Q9ULB4 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CDH9Q9ULB4 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
CDH9Q9ULB4 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDH9Q9ULB4 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDH9Q9ULB4 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDH9Q9ULB4 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDH9Q9ULB4 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDH9Q9ULB4 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDH9Q9ULB4 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CDH9Q9ULB4 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDH9Q9ULB4 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDH9Q9ULB4 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDH9Q9ULB4 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDH9Q9ULB4 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDH9Q9ULB4 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDH9Q9ULB4 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDH9Q9ULB4 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDH9Q9ULB4 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CDH9Q9ULB4 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDH9Q9ULB4 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDH9Q9ULB4 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CDH9Q9ULB4 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDH9Q9ULB4 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDH9Q9ULB4 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDH9Q9ULB4 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDH9Q9ULB4 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDH9Q9ULB4 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDH9Q9ULB4 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDH9Q9ULB4 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDH9Q9ULB4 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDH9Q9ULB4 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDH9Q9ULB4 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDH9Q9ULB4 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDH9Q9ULB4 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDH9Q9ULB4 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDH9Q9ULB4 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDH9Q9ULB4 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CDH9Q9ULB4 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDH9Q9ULB4 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDH9Q9ULB4 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDH9Q9ULB4 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDH9Q9ULB4 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CDH9Q9ULB4 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDH9Q9ULB4 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDH9Q9ULB4 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDH9Q9ULB4 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDH9Q9ULB4 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms