Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKT5

FBXO4, F-box only protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO4Q9UKT5 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FBXO4Q9UKT5 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FBXO4Q9UKT5 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FBXO4Q9UKT5 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FBXO4Q9UKT5 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
FBXO4Q9UKT5 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FBXO4Q9UKT5 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FBXO4Q9UKT5 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
FBXO4Q9UKT5 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FBXO4Q9UKT5 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FBXO4Q9UKT5 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FBXO4Q9UKT5 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FBXO4Q9UKT5 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FBXO4Q9UKT5 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FBXO4Q9UKT5 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FBXO4Q9UKT5 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FBXO4Q9UKT5 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FBXO4Q9UKT5 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FBXO4Q9UKT5 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
FBXO4Q9UKT5 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
FBXO4Q9UKT5 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FBXO4Q9UKT5 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FBXO4Q9UKT5 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FBXO4Q9UKT5 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FBXO4Q9UKT5 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FBXO4Q9UKT5 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
FBXO4Q9UKT5 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FBXO4Q9UKT5 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FBXO4Q9UKT5 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FBXO4Q9UKT5 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FBXO4Q9UKT5 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FBXO4Q9UKT5 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FBXO4Q9UKT5 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FBXO4Q9UKT5 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
FBXO4Q9UKT5 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FBXO4Q9UKT5 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FBXO4Q9UKT5 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FBXO4Q9UKT5 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FBXO4Q9UKT5 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FBXO4Q9UKT5 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FBXO4Q9UKT5 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FBXO4Q9UKT5 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FBXO4Q9UKT5 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FBXO4Q9UKT5 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FBXO4Q9UKT5 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FBXO4Q9UKT5 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FBXO4Q9UKT5 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FBXO4Q9UKT5 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
FBXO4Q9UKT5 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FBXO4Q9UKT5 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FBXO4Q9UKT5 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
FBXO4Q9UKT5 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FBXO4Q9UKT5 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FBXO4Q9UKT5 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FBXO4Q9UKT5 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FBXO4Q9UKT5 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FBXO4Q9UKT5 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FBXO4Q9UKT5 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FBXO4Q9UKT5 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FBXO4Q9UKT5 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
FBXO4Q9UKT5 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FBXO4Q9UKT5 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FBXO4Q9UKT5 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FBXO4Q9UKT5 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FBXO4Q9UKT5 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
FBXO4Q9UKT5 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FBXO4Q9UKT5 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FBXO4Q9UKT5 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FBXO4Q9UKT5 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FBXO4Q9UKT5 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FBXO4Q9UKT5 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FBXO4Q9UKT5 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FBXO4Q9UKT5 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FBXO4Q9UKT5 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FBXO4Q9UKT5 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FBXO4Q9UKT5 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FBXO4Q9UKT5 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FBXO4Q9UKT5 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
FBXO4Q9UKT5 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FBXO4Q9UKT5 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FBXO4Q9UKT5 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FBXO4Q9UKT5 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FBXO4Q9UKT5 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FBXO4Q9UKT5 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FBXO4Q9UKT5 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FBXO4Q9UKT5 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
FBXO4Q9UKT5 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
FBXO4Q9UKT5 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
FBXO4Q9UKT5 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
FBXO4Q9UKT5 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FBXO4Q9UKT5 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FBXO4Q9UKT5 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FBXO4Q9UKT5 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FBXO4Q9UKT5 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FBXO4Q9UKT5 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FBXO4Q9UKT5 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FBXO4Q9UKT5 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FBXO4Q9UKT5 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FBXO4Q9UKT5 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FBXO4Q9UKT5 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms