Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJD0

RIMS3, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIMS3Q9UJD0 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RIMS3Q9UJD0 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RIMS3Q9UJD0 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
RIMS3Q9UJD0 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RIMS3Q9UJD0 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RIMS3Q9UJD0 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RIMS3Q9UJD0 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RIMS3Q9UJD0 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RIMS3Q9UJD0 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RIMS3Q9UJD0 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RIMS3Q9UJD0 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RIMS3Q9UJD0 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RIMS3Q9UJD0 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RIMS3Q9UJD0 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RIMS3Q9UJD0 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RIMS3Q9UJD0 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
RIMS3Q9UJD0 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RIMS3Q9UJD0 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RIMS3Q9UJD0 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RIMS3Q9UJD0 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RIMS3Q9UJD0 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RIMS3Q9UJD0 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RIMS3Q9UJD0 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RIMS3Q9UJD0 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RIMS3Q9UJD0 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RIMS3Q9UJD0 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RIMS3Q9UJD0 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RIMS3Q9UJD0 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RIMS3Q9UJD0 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RIMS3Q9UJD0 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RIMS3Q9UJD0 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RIMS3Q9UJD0 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RIMS3Q9UJD0 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
RIMS3Q9UJD0 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RIMS3Q9UJD0 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RIMS3Q9UJD0 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RIMS3Q9UJD0 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RIMS3Q9UJD0 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RIMS3Q9UJD0 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RIMS3Q9UJD0 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RIMS3Q9UJD0 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RIMS3Q9UJD0 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RIMS3Q9UJD0 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RIMS3Q9UJD0 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RIMS3Q9UJD0 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RIMS3Q9UJD0 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RIMS3Q9UJD0 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
RIMS3Q9UJD0 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RIMS3Q9UJD0 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RIMS3Q9UJD0 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RIMS3Q9UJD0 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RIMS3Q9UJD0 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RIMS3Q9UJD0 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RIMS3Q9UJD0 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
RIMS3Q9UJD0 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RIMS3Q9UJD0 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RIMS3Q9UJD0 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RIMS3Q9UJD0 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RIMS3Q9UJD0 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RIMS3Q9UJD0 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RIMS3Q9UJD0 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RIMS3Q9UJD0 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RIMS3Q9UJD0 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RIMS3Q9UJD0 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RIMS3Q9UJD0 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RIMS3Q9UJD0 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
RIMS3Q9UJD0 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
RIMS3Q9UJD0 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
RIMS3Q9UJD0 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
RIMS3Q9UJD0 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
RIMS3Q9UJD0 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RIMS3Q9UJD0 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RIMS3Q9UJD0 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RIMS3Q9UJD0 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RIMS3Q9UJD0 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RIMS3Q9UJD0 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RIMS3Q9UJD0 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RIMS3Q9UJD0 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RIMS3Q9UJD0 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RIMS3Q9UJD0 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RIMS3Q9UJD0 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RIMS3Q9UJD0 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RIMS3Q9UJD0 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RIMS3Q9UJD0 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RIMS3Q9UJD0 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RIMS3Q9UJD0 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RIMS3Q9UJD0 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
RIMS3Q9UJD0 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RIMS3Q9UJD0 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RIMS3Q9UJD0 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RIMS3Q9UJD0 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RIMS3Q9UJD0 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RIMS3Q9UJD0 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RIMS3Q9UJD0 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RIMS3Q9UJD0 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RIMS3Q9UJD0 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RIMS3Q9UJD0 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RIMS3Q9UJD0 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RIMS3Q9UJD0 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RIMS3Q9UJD0 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms