Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ68

MSRA, Mitochondrial peptide methionine sulfoxide reductase, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSRAQ9UJ68 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
MSRAQ9UJ68 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MSRAQ9UJ68 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MSRAQ9UJ68 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MSRAQ9UJ68 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
MSRAQ9UJ68 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MSRAQ9UJ68 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MSRAQ9UJ68 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MSRAQ9UJ68 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MSRAQ9UJ68 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MSRAQ9UJ68 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MSRAQ9UJ68 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MSRAQ9UJ68 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MSRAQ9UJ68 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MSRAQ9UJ68 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MSRAQ9UJ68 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
MSRAQ9UJ68 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
MSRAQ9UJ68 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
MSRAQ9UJ68 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MSRAQ9UJ68 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MSRAQ9UJ68 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MSRAQ9UJ68 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MSRAQ9UJ68 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MSRAQ9UJ68 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
MSRAQ9UJ68 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MSRAQ9UJ68 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MSRAQ9UJ68 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MSRAQ9UJ68 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MSRAQ9UJ68 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MSRAQ9UJ68 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MSRAQ9UJ68 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MSRAQ9UJ68 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MSRAQ9UJ68 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MSRAQ9UJ68 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
MSRAQ9UJ68 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MSRAQ9UJ68 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MSRAQ9UJ68 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MSRAQ9UJ68 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MSRAQ9UJ68 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
MSRAQ9UJ68 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MSRAQ9UJ68 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MSRAQ9UJ68 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MSRAQ9UJ68 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MSRAQ9UJ68 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
MSRAQ9UJ68 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MSRAQ9UJ68 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MSRAQ9UJ68 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MSRAQ9UJ68 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MSRAQ9UJ68 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MSRAQ9UJ68 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MSRAQ9UJ68 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MSRAQ9UJ68 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MSRAQ9UJ68 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MSRAQ9UJ68 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MSRAQ9UJ68 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MSRAQ9UJ68 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MSRAQ9UJ68 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MSRAQ9UJ68 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MSRAQ9UJ68 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MSRAQ9UJ68 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MSRAQ9UJ68 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MSRAQ9UJ68 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MSRAQ9UJ68 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MSRAQ9UJ68 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MSRAQ9UJ68 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MSRAQ9UJ68 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MSRAQ9UJ68 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MSRAQ9UJ68 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MSRAQ9UJ68 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MSRAQ9UJ68 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MSRAQ9UJ68 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MSRAQ9UJ68 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MSRAQ9UJ68 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MSRAQ9UJ68 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MSRAQ9UJ68 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MSRAQ9UJ68 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MSRAQ9UJ68 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MSRAQ9UJ68 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MSRAQ9UJ68 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MSRAQ9UJ68 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MSRAQ9UJ68 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MSRAQ9UJ68 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MSRAQ9UJ68 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MSRAQ9UJ68 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MSRAQ9UJ68 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MSRAQ9UJ68 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
MSRAQ9UJ68 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MSRAQ9UJ68 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
MSRAQ9UJ68 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
MSRAQ9UJ68 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC24■■□□□ 1.43
MSRAQ9UJ68 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MSRAQ9UJ68 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MSRAQ9UJ68 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MSRAQ9UJ68 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
MSRAQ9UJ68 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MSRAQ9UJ68 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MSRAQ9UJ68 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MSRAQ9UJ68 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MSRAQ9UJ68 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
MSRAQ9UJ68 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms