Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIU6

SIX4, Homeobox protein SIX4, humanhuman

Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX4Q9UIU6 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SIX4Q9UIU6 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SIX4Q9UIU6 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SIX4Q9UIU6 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SIX4Q9UIU6 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SIX4Q9UIU6 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SIX4Q9UIU6 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SIX4Q9UIU6 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24■■□□□ 1.43
SIX4Q9UIU6 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SIX4Q9UIU6 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC24■■□□□ 1.43
SIX4Q9UIU6 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SIX4Q9UIU6 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SIX4Q9UIU6 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SIX4Q9UIU6 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SIX4Q9UIU6 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SIX4Q9UIU6 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SIX4Q9UIU6 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SIX4Q9UIU6 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SIX4Q9UIU6 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SIX4Q9UIU6 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SIX4Q9UIU6 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SIX4Q9UIU6 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SIX4Q9UIU6 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SIX4Q9UIU6 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
SIX4Q9UIU6 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SIX4Q9UIU6 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SIX4Q9UIU6 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SIX4Q9UIU6 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SIX4Q9UIU6 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SIX4Q9UIU6 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SIX4Q9UIU6 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SIX4Q9UIU6 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SIX4Q9UIU6 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SIX4Q9UIU6 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SIX4Q9UIU6 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SIX4Q9UIU6 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SIX4Q9UIU6 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SIX4Q9UIU6 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SIX4Q9UIU6 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SIX4Q9UIU6 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SIX4Q9UIU6 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SIX4Q9UIU6 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SIX4Q9UIU6 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SIX4Q9UIU6 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
SIX4Q9UIU6 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SIX4Q9UIU6 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SIX4Q9UIU6 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SIX4Q9UIU6 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SIX4Q9UIU6 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SIX4Q9UIU6 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SIX4Q9UIU6 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SIX4Q9UIU6 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SIX4Q9UIU6 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SIX4Q9UIU6 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SIX4Q9UIU6 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SIX4Q9UIU6 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SIX4Q9UIU6 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
SIX4Q9UIU6 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
SIX4Q9UIU6 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SIX4Q9UIU6 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
SIX4Q9UIU6 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SIX4Q9UIU6 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SIX4Q9UIU6 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SIX4Q9UIU6 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SIX4Q9UIU6 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SIX4Q9UIU6 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SIX4Q9UIU6 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SIX4Q9UIU6 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SIX4Q9UIU6 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SIX4Q9UIU6 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SIX4Q9UIU6 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SIX4Q9UIU6 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SIX4Q9UIU6 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SIX4Q9UIU6 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
SIX4Q9UIU6 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
SIX4Q9UIU6 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SIX4Q9UIU6 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SIX4Q9UIU6 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SIX4Q9UIU6 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SIX4Q9UIU6 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SIX4Q9UIU6 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SIX4Q9UIU6 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SIX4Q9UIU6 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SIX4Q9UIU6 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
SIX4Q9UIU6 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SIX4Q9UIU6 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SIX4Q9UIU6 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SIX4Q9UIU6 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SIX4Q9UIU6 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SIX4Q9UIU6 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SIX4Q9UIU6 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SIX4Q9UIU6 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SIX4Q9UIU6 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SIX4Q9UIU6 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SIX4Q9UIU6 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
SIX4Q9UIU6 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SIX4Q9UIU6 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SIX4Q9UIU6 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SIX4Q9UIU6 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SIX4Q9UIU6 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.9 ms