Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHM6

OPN4, Melanopsin, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPN4Q9UHM6 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
OPN4Q9UHM6 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
OPN4Q9UHM6 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
OPN4Q9UHM6 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
OPN4Q9UHM6 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
OPN4Q9UHM6 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
OPN4Q9UHM6 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
OPN4Q9UHM6 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
OPN4Q9UHM6 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
OPN4Q9UHM6 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
OPN4Q9UHM6 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
OPN4Q9UHM6 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
OPN4Q9UHM6 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
OPN4Q9UHM6 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
OPN4Q9UHM6 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
OPN4Q9UHM6 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
OPN4Q9UHM6 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
OPN4Q9UHM6 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
OPN4Q9UHM6 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
OPN4Q9UHM6 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
OPN4Q9UHM6 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
OPN4Q9UHM6 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
OPN4Q9UHM6 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
OPN4Q9UHM6 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
OPN4Q9UHM6 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
OPN4Q9UHM6 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
OPN4Q9UHM6 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
OPN4Q9UHM6 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
OPN4Q9UHM6 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
OPN4Q9UHM6 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
OPN4Q9UHM6 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
OPN4Q9UHM6 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
OPN4Q9UHM6 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC19.25■□□□□ 0.67
OPN4Q9UHM6 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
OPN4Q9UHM6 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
OPN4Q9UHM6 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
OPN4Q9UHM6 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
OPN4Q9UHM6 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
OPN4Q9UHM6 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
OPN4Q9UHM6 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
OPN4Q9UHM6 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
OPN4Q9UHM6 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
OPN4Q9UHM6 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
OPN4Q9UHM6 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
OPN4Q9UHM6 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
OPN4Q9UHM6 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
OPN4Q9UHM6 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
OPN4Q9UHM6 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
OPN4Q9UHM6 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
OPN4Q9UHM6 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
OPN4Q9UHM6 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
OPN4Q9UHM6 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
OPN4Q9UHM6 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
OPN4Q9UHM6 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
OPN4Q9UHM6 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
OPN4Q9UHM6 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
OPN4Q9UHM6 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
OPN4Q9UHM6 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
OPN4Q9UHM6 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
OPN4Q9UHM6 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
OPN4Q9UHM6 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
OPN4Q9UHM6 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
OPN4Q9UHM6 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
OPN4Q9UHM6 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
OPN4Q9UHM6 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
OPN4Q9UHM6 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
OPN4Q9UHM6 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
OPN4Q9UHM6 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
OPN4Q9UHM6 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
OPN4Q9UHM6 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
OPN4Q9UHM6 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
OPN4Q9UHM6 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
OPN4Q9UHM6 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
OPN4Q9UHM6 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
OPN4Q9UHM6 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
OPN4Q9UHM6 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
OPN4Q9UHM6 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
OPN4Q9UHM6 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
OPN4Q9UHM6 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
OPN4Q9UHM6 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
OPN4Q9UHM6 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
OPN4Q9UHM6 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
OPN4Q9UHM6 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
OPN4Q9UHM6 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
OPN4Q9UHM6 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
OPN4Q9UHM6 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
OPN4Q9UHM6 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
OPN4Q9UHM6 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
OPN4Q9UHM6 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
OPN4Q9UHM6 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
OPN4Q9UHM6 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
OPN4Q9UHM6 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
OPN4Q9UHM6 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
OPN4Q9UHM6 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
OPN4Q9UHM6 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
OPN4Q9UHM6 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
OPN4Q9UHM6 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
OPN4Q9UHM6 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
OPN4Q9UHM6 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
OPN4Q9UHM6 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.2 ms