Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC6

CNTNAP2, Contactin-associated protein-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTNAP2Q9UHC6 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CNTNAP2Q9UHC6 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CNTNAP2Q9UHC6 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CNTNAP2Q9UHC6 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CNTNAP2Q9UHC6 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CNTNAP2Q9UHC6 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CNTNAP2Q9UHC6 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CNTNAP2Q9UHC6 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CNTNAP2Q9UHC6 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CNTNAP2Q9UHC6 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CNTNAP2Q9UHC6 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CNTNAP2Q9UHC6 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CNTNAP2Q9UHC6 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CNTNAP2Q9UHC6 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CNTNAP2Q9UHC6 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CNTNAP2Q9UHC6 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CNTNAP2Q9UHC6 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CNTNAP2Q9UHC6 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CNTNAP2Q9UHC6 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CNTNAP2Q9UHC6 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CNTNAP2Q9UHC6 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CNTNAP2Q9UHC6 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CNTNAP2Q9UHC6 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CNTNAP2Q9UHC6 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CNTNAP2Q9UHC6 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CNTNAP2Q9UHC6 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CNTNAP2Q9UHC6 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CNTNAP2Q9UHC6 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CNTNAP2Q9UHC6 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CNTNAP2Q9UHC6 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CNTNAP2Q9UHC6 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CNTNAP2Q9UHC6 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CNTNAP2Q9UHC6 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CNTNAP2Q9UHC6 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CNTNAP2Q9UHC6 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CNTNAP2Q9UHC6 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CNTNAP2Q9UHC6 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CNTNAP2Q9UHC6 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CNTNAP2Q9UHC6 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CNTNAP2Q9UHC6 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CNTNAP2Q9UHC6 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CNTNAP2Q9UHC6 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CNTNAP2Q9UHC6 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CNTNAP2Q9UHC6 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CNTNAP2Q9UHC6 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CNTNAP2Q9UHC6 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CNTNAP2Q9UHC6 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CNTNAP2Q9UHC6 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CNTNAP2Q9UHC6 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CNTNAP2Q9UHC6 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CNTNAP2Q9UHC6 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CNTNAP2Q9UHC6 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CNTNAP2Q9UHC6 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CNTNAP2Q9UHC6 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CNTNAP2Q9UHC6 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CNTNAP2Q9UHC6 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CNTNAP2Q9UHC6 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CNTNAP2Q9UHC6 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CNTNAP2Q9UHC6 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CNTNAP2Q9UHC6 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CNTNAP2Q9UHC6 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CNTNAP2Q9UHC6 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CNTNAP2Q9UHC6 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CNTNAP2Q9UHC6 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CNTNAP2Q9UHC6 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CNTNAP2Q9UHC6 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CNTNAP2Q9UHC6 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CNTNAP2Q9UHC6 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CNTNAP2Q9UHC6 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CNTNAP2Q9UHC6 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CNTNAP2Q9UHC6 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CNTNAP2Q9UHC6 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CNTNAP2Q9UHC6 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CNTNAP2Q9UHC6 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CNTNAP2Q9UHC6 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CNTNAP2Q9UHC6 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CNTNAP2Q9UHC6 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CNTNAP2Q9UHC6 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CNTNAP2Q9UHC6 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
CNTNAP2Q9UHC6 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CNTNAP2Q9UHC6 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CNTNAP2Q9UHC6 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CNTNAP2Q9UHC6 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CNTNAP2Q9UHC6 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CNTNAP2Q9UHC6 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CNTNAP2Q9UHC6 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CNTNAP2Q9UHC6 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CNTNAP2Q9UHC6 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CNTNAP2Q9UHC6 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CNTNAP2Q9UHC6 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CNTNAP2Q9UHC6 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CNTNAP2Q9UHC6 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CNTNAP2Q9UHC6 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CNTNAP2Q9UHC6 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CNTNAP2Q9UHC6 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CNTNAP2Q9UHC6 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CNTNAP2Q9UHC6 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CNTNAP2Q9UHC6 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CNTNAP2Q9UHC6 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CNTNAP2Q9UHC6 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms