Protein–RNA interactions for Protein: Q9UH03

SEPT3, Neuronal-specific septin-3, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEPT3Q9UH03 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SEPT3Q9UH03 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SEPT3Q9UH03 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SEPT3Q9UH03 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SEPT3Q9UH03 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SEPT3Q9UH03 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SEPT3Q9UH03 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SEPT3Q9UH03 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SEPT3Q9UH03 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SEPT3Q9UH03 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SEPT3Q9UH03 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SEPT3Q9UH03 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SEPT3Q9UH03 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SEPT3Q9UH03 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SEPT3Q9UH03 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SEPT3Q9UH03 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SEPT3Q9UH03 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SEPT3Q9UH03 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SEPT3Q9UH03 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SEPT3Q9UH03 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SEPT3Q9UH03 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SEPT3Q9UH03 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SEPT3Q9UH03 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SEPT3Q9UH03 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SEPT3Q9UH03 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SEPT3Q9UH03 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SEPT3Q9UH03 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SEPT3Q9UH03 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SEPT3Q9UH03 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SEPT3Q9UH03 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SEPT3Q9UH03 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SEPT3Q9UH03 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SEPT3Q9UH03 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SEPT3Q9UH03 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SEPT3Q9UH03 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SEPT3Q9UH03 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SEPT3Q9UH03 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SEPT3Q9UH03 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SEPT3Q9UH03 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SEPT3Q9UH03 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SEPT3Q9UH03 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SEPT3Q9UH03 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SEPT3Q9UH03 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SEPT3Q9UH03 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SEPT3Q9UH03 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SEPT3Q9UH03 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SEPT3Q9UH03 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SEPT3Q9UH03 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SEPT3Q9UH03 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SEPT3Q9UH03 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SEPT3Q9UH03 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SEPT3Q9UH03 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SEPT3Q9UH03 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SEPT3Q9UH03 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SEPT3Q9UH03 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SEPT3Q9UH03 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SEPT3Q9UH03 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SEPT3Q9UH03 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SEPT3Q9UH03 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SEPT3Q9UH03 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SEPT3Q9UH03 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SEPT3Q9UH03 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SEPT3Q9UH03 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SEPT3Q9UH03 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SEPT3Q9UH03 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SEPT3Q9UH03 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SEPT3Q9UH03 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SEPT3Q9UH03 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SEPT3Q9UH03 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SEPT3Q9UH03 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SEPT3Q9UH03 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SEPT3Q9UH03 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SEPT3Q9UH03 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SEPT3Q9UH03 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SEPT3Q9UH03 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SEPT3Q9UH03 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SEPT3Q9UH03 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SEPT3Q9UH03 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SEPT3Q9UH03 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SEPT3Q9UH03 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SEPT3Q9UH03 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SEPT3Q9UH03 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SEPT3Q9UH03 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SEPT3Q9UH03 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SEPT3Q9UH03 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SEPT3Q9UH03 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SEPT3Q9UH03 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SEPT3Q9UH03 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SEPT3Q9UH03 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SEPT3Q9UH03 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SEPT3Q9UH03 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SEPT3Q9UH03 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SEPT3Q9UH03 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SEPT3Q9UH03 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SEPT3Q9UH03 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SEPT3Q9UH03 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SEPT3Q9UH03 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SEPT3Q9UH03 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SEPT3Q9UH03 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SEPT3Q9UH03 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms