Protein–RNA interactions for Protein: Q9UD57

NKX1-2, NK1 transcription factor-related protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX1-2Q9UD57 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
NKX1-2Q9UD57 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NKX1-2Q9UD57 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NKX1-2Q9UD57 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NKX1-2Q9UD57 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NKX1-2Q9UD57 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NKX1-2Q9UD57 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NKX1-2Q9UD57 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NKX1-2Q9UD57 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NKX1-2Q9UD57 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NKX1-2Q9UD57 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NKX1-2Q9UD57 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■□□□□ 0.99
NKX1-2Q9UD57 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
NKX1-2Q9UD57 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
NKX1-2Q9UD57 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
NKX1-2Q9UD57 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
NKX1-2Q9UD57 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NKX1-2Q9UD57 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NKX1-2Q9UD57 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NKX1-2Q9UD57 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NKX1-2Q9UD57 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NKX1-2Q9UD57 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NKX1-2Q9UD57 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NKX1-2Q9UD57 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NKX1-2Q9UD57 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NKX1-2Q9UD57 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NKX1-2Q9UD57 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NKX1-2Q9UD57 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NKX1-2Q9UD57 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NKX1-2Q9UD57 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
NKX1-2Q9UD57 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NKX1-2Q9UD57 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NKX1-2Q9UD57 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
NKX1-2Q9UD57 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NKX1-2Q9UD57 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NKX1-2Q9UD57 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NKX1-2Q9UD57 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NKX1-2Q9UD57 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NKX1-2Q9UD57 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NKX1-2Q9UD57 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NKX1-2Q9UD57 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
NKX1-2Q9UD57 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NKX1-2Q9UD57 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NKX1-2Q9UD57 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NKX1-2Q9UD57 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NKX1-2Q9UD57 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NKX1-2Q9UD57 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NKX1-2Q9UD57 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NKX1-2Q9UD57 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NKX1-2Q9UD57 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NKX1-2Q9UD57 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NKX1-2Q9UD57 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NKX1-2Q9UD57 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NKX1-2Q9UD57 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NKX1-2Q9UD57 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NKX1-2Q9UD57 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NKX1-2Q9UD57 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NKX1-2Q9UD57 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NKX1-2Q9UD57 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NKX1-2Q9UD57 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NKX1-2Q9UD57 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NKX1-2Q9UD57 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NKX1-2Q9UD57 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NKX1-2Q9UD57 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NKX1-2Q9UD57 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NKX1-2Q9UD57 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NKX1-2Q9UD57 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NKX1-2Q9UD57 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NKX1-2Q9UD57 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NKX1-2Q9UD57 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NKX1-2Q9UD57 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NKX1-2Q9UD57 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NKX1-2Q9UD57 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NKX1-2Q9UD57 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NKX1-2Q9UD57 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NKX1-2Q9UD57 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NKX1-2Q9UD57 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NKX1-2Q9UD57 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NKX1-2Q9UD57 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NKX1-2Q9UD57 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NKX1-2Q9UD57 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NKX1-2Q9UD57 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NKX1-2Q9UD57 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NKX1-2Q9UD57 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NKX1-2Q9UD57 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NKX1-2Q9UD57 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NKX1-2Q9UD57 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NKX1-2Q9UD57 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NKX1-2Q9UD57 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NKX1-2Q9UD57 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NKX1-2Q9UD57 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NKX1-2Q9UD57 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NKX1-2Q9UD57 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NKX1-2Q9UD57 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NKX1-2Q9UD57 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NKX1-2Q9UD57 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NKX1-2Q9UD57 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NKX1-2Q9UD57 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NKX1-2Q9UD57 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NKX1-2Q9UD57 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 219.4 ms