Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBC9

SPRR3, Small proline-rich protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPRR3Q9UBC9 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SPRR3Q9UBC9 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SPRR3Q9UBC9 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SPRR3Q9UBC9 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SPRR3Q9UBC9 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SPRR3Q9UBC9 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
SPRR3Q9UBC9 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SPRR3Q9UBC9 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SPRR3Q9UBC9 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SPRR3Q9UBC9 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SPRR3Q9UBC9 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SPRR3Q9UBC9 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SPRR3Q9UBC9 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SPRR3Q9UBC9 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SPRR3Q9UBC9 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SPRR3Q9UBC9 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SPRR3Q9UBC9 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
SPRR3Q9UBC9 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
SPRR3Q9UBC9 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SPRR3Q9UBC9 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SPRR3Q9UBC9 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SPRR3Q9UBC9 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SPRR3Q9UBC9 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SPRR3Q9UBC9 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SPRR3Q9UBC9 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SPRR3Q9UBC9 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SPRR3Q9UBC9 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SPRR3Q9UBC9 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SPRR3Q9UBC9 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SPRR3Q9UBC9 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SPRR3Q9UBC9 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
SPRR3Q9UBC9 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SPRR3Q9UBC9 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SPRR3Q9UBC9 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SPRR3Q9UBC9 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SPRR3Q9UBC9 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SPRR3Q9UBC9 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
SPRR3Q9UBC9 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SPRR3Q9UBC9 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SPRR3Q9UBC9 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SPRR3Q9UBC9 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SPRR3Q9UBC9 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SPRR3Q9UBC9 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SPRR3Q9UBC9 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SPRR3Q9UBC9 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SPRR3Q9UBC9 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SPRR3Q9UBC9 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SPRR3Q9UBC9 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
SPRR3Q9UBC9 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
SPRR3Q9UBC9 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SPRR3Q9UBC9 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SPRR3Q9UBC9 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SPRR3Q9UBC9 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SPRR3Q9UBC9 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SPRR3Q9UBC9 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SPRR3Q9UBC9 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SPRR3Q9UBC9 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC20■□□□□ 0.79
SPRR3Q9UBC9 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SPRR3Q9UBC9 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SPRR3Q9UBC9 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SPRR3Q9UBC9 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SPRR3Q9UBC9 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SPRR3Q9UBC9 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SPRR3Q9UBC9 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SPRR3Q9UBC9 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SPRR3Q9UBC9 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SPRR3Q9UBC9 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
SPRR3Q9UBC9 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SPRR3Q9UBC9 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SPRR3Q9UBC9 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SPRR3Q9UBC9 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SPRR3Q9UBC9 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SPRR3Q9UBC9 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
SPRR3Q9UBC9 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SPRR3Q9UBC9 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SPRR3Q9UBC9 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SPRR3Q9UBC9 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SPRR3Q9UBC9 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SPRR3Q9UBC9 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SPRR3Q9UBC9 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SPRR3Q9UBC9 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SPRR3Q9UBC9 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SPRR3Q9UBC9 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SPRR3Q9UBC9 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SPRR3Q9UBC9 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SPRR3Q9UBC9 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SPRR3Q9UBC9 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SPRR3Q9UBC9 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SPRR3Q9UBC9 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SPRR3Q9UBC9 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SPRR3Q9UBC9 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SPRR3Q9UBC9 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SPRR3Q9UBC9 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SPRR3Q9UBC9 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SPRR3Q9UBC9 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SPRR3Q9UBC9 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SPRR3Q9UBC9 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SPRR3Q9UBC9 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SPRR3Q9UBC9 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SPRR3Q9UBC9 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms