Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBC5

MYO1A, Unconventional myosin-Ia, humanhuman

Predictions only

Length 1,043 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYO1AQ9UBC5 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MYO1AQ9UBC5 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MYO1AQ9UBC5 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MYO1AQ9UBC5 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MYO1AQ9UBC5 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MYO1AQ9UBC5 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MYO1AQ9UBC5 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MYO1AQ9UBC5 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MYO1AQ9UBC5 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MYO1AQ9UBC5 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MYO1AQ9UBC5 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MYO1AQ9UBC5 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MYO1AQ9UBC5 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MYO1AQ9UBC5 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
MYO1AQ9UBC5 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
MYO1AQ9UBC5 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MYO1AQ9UBC5 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MYO1AQ9UBC5 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MYO1AQ9UBC5 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MYO1AQ9UBC5 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MYO1AQ9UBC5 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MYO1AQ9UBC5 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MYO1AQ9UBC5 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MYO1AQ9UBC5 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MYO1AQ9UBC5 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MYO1AQ9UBC5 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MYO1AQ9UBC5 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MYO1AQ9UBC5 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MYO1AQ9UBC5 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MYO1AQ9UBC5 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MYO1AQ9UBC5 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MYO1AQ9UBC5 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MYO1AQ9UBC5 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MYO1AQ9UBC5 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MYO1AQ9UBC5 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MYO1AQ9UBC5 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MYO1AQ9UBC5 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MYO1AQ9UBC5 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MYO1AQ9UBC5 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MYO1AQ9UBC5 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MYO1AQ9UBC5 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MYO1AQ9UBC5 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MYO1AQ9UBC5 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MYO1AQ9UBC5 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MYO1AQ9UBC5 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MYO1AQ9UBC5 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MYO1AQ9UBC5 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MYO1AQ9UBC5 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MYO1AQ9UBC5 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MYO1AQ9UBC5 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
MYO1AQ9UBC5 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MYO1AQ9UBC5 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MYO1AQ9UBC5 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MYO1AQ9UBC5 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MYO1AQ9UBC5 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MYO1AQ9UBC5 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MYO1AQ9UBC5 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MYO1AQ9UBC5 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MYO1AQ9UBC5 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MYO1AQ9UBC5 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MYO1AQ9UBC5 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MYO1AQ9UBC5 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MYO1AQ9UBC5 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MYO1AQ9UBC5 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MYO1AQ9UBC5 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MYO1AQ9UBC5 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MYO1AQ9UBC5 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MYO1AQ9UBC5 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MYO1AQ9UBC5 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MYO1AQ9UBC5 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MYO1AQ9UBC5 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MYO1AQ9UBC5 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
MYO1AQ9UBC5 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MYO1AQ9UBC5 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MYO1AQ9UBC5 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MYO1AQ9UBC5 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MYO1AQ9UBC5 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MYO1AQ9UBC5 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MYO1AQ9UBC5 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MYO1AQ9UBC5 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MYO1AQ9UBC5 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MYO1AQ9UBC5 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MYO1AQ9UBC5 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MYO1AQ9UBC5 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MYO1AQ9UBC5 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MYO1AQ9UBC5 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MYO1AQ9UBC5 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MYO1AQ9UBC5 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MYO1AQ9UBC5 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MYO1AQ9UBC5 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MYO1AQ9UBC5 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MYO1AQ9UBC5 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
MYO1AQ9UBC5 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MYO1AQ9UBC5 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
MYO1AQ9UBC5 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
MYO1AQ9UBC5 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
MYO1AQ9UBC5 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MYO1AQ9UBC5 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MYO1AQ9UBC5 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MYO1AQ9UBC5 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms