Protein–RNA interactions for Protein: Q9QC07

ERVK-18, Endogenous retrovirus group K member 18 Pol protein, humanhuman

Predictions only

Length 812 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-18Q9QC07 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ERVK-18Q9QC07 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ERVK-18Q9QC07 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ERVK-18Q9QC07 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ERVK-18Q9QC07 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ERVK-18Q9QC07 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ERVK-18Q9QC07 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ERVK-18Q9QC07 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ERVK-18Q9QC07 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ERVK-18Q9QC07 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ERVK-18Q9QC07 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ERVK-18Q9QC07 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ERVK-18Q9QC07 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ERVK-18Q9QC07 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ERVK-18Q9QC07 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ERVK-18Q9QC07 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ERVK-18Q9QC07 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ERVK-18Q9QC07 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ERVK-18Q9QC07 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ERVK-18Q9QC07 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ERVK-18Q9QC07 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ERVK-18Q9QC07 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ERVK-18Q9QC07 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ERVK-18Q9QC07 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ERVK-18Q9QC07 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ERVK-18Q9QC07 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ERVK-18Q9QC07 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ERVK-18Q9QC07 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ERVK-18Q9QC07 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ERVK-18Q9QC07 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ERVK-18Q9QC07 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ERVK-18Q9QC07 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ERVK-18Q9QC07 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ERVK-18Q9QC07 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ERVK-18Q9QC07 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ERVK-18Q9QC07 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ERVK-18Q9QC07 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ERVK-18Q9QC07 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ERVK-18Q9QC07 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ERVK-18Q9QC07 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ERVK-18Q9QC07 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ERVK-18Q9QC07 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ERVK-18Q9QC07 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ERVK-18Q9QC07 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
ERVK-18Q9QC07 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
ERVK-18Q9QC07 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ERVK-18Q9QC07 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ERVK-18Q9QC07 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ERVK-18Q9QC07 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ERVK-18Q9QC07 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
ERVK-18Q9QC07 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ERVK-18Q9QC07 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
ERVK-18Q9QC07 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ERVK-18Q9QC07 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ERVK-18Q9QC07 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
ERVK-18Q9QC07 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ERVK-18Q9QC07 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ERVK-18Q9QC07 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ERVK-18Q9QC07 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ERVK-18Q9QC07 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ERVK-18Q9QC07 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
ERVK-18Q9QC07 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ERVK-18Q9QC07 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ERVK-18Q9QC07 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ERVK-18Q9QC07 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ERVK-18Q9QC07 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ERVK-18Q9QC07 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ERVK-18Q9QC07 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ERVK-18Q9QC07 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ERVK-18Q9QC07 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ERVK-18Q9QC07 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ERVK-18Q9QC07 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
ERVK-18Q9QC07 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ERVK-18Q9QC07 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ERVK-18Q9QC07 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ERVK-18Q9QC07 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ERVK-18Q9QC07 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ERVK-18Q9QC07 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ERVK-18Q9QC07 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ERVK-18Q9QC07 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ERVK-18Q9QC07 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
ERVK-18Q9QC07 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
ERVK-18Q9QC07 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ERVK-18Q9QC07 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ERVK-18Q9QC07 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ERVK-18Q9QC07 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ERVK-18Q9QC07 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ERVK-18Q9QC07 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ERVK-18Q9QC07 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
ERVK-18Q9QC07 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ERVK-18Q9QC07 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ERVK-18Q9QC07 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ERVK-18Q9QC07 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ERVK-18Q9QC07 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ERVK-18Q9QC07 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ERVK-18Q9QC07 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ERVK-18Q9QC07 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ERVK-18Q9QC07 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ERVK-18Q9QC07 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ERVK-18Q9QC07 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.1 ms