Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2K1

CC2D2A, Coiled-coil and C2 domain-containing protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,620 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CC2D2AQ9P2K1 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC40.96■■■■■ 4.15
CC2D2AQ9P2K1 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC40.96■■■■■ 4.15
CC2D2AQ9P2K1 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC40.96■■■■■ 4.15
CC2D2AQ9P2K1 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.95■■■■■ 4.15
CC2D2AQ9P2K1 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC40.95■■■■■ 4.15
CC2D2AQ9P2K1 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC40.95■■■■■ 4.15
CC2D2AQ9P2K1 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC40.95■■■■■ 4.15
CC2D2AQ9P2K1 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.95■■■■■ 4.15
CC2D2AQ9P2K1 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC40.95■■■■■ 4.15
CC2D2AQ9P2K1 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC40.94■■■■■ 4.14
CC2D2AQ9P2K1 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC40.94■■■■■ 4.14
CC2D2AQ9P2K1 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.94■■■■■ 4.14
CC2D2AQ9P2K1 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.94■■■■■ 4.14
CC2D2AQ9P2K1 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.94■■■■■ 4.14
CC2D2AQ9P2K1 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC40.94■■■■■ 4.14
CC2D2AQ9P2K1 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.93■■■■■ 4.14
CC2D2AQ9P2K1 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC40.93■■■■■ 4.14
CC2D2AQ9P2K1 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC40.93■■■■■ 4.14
CC2D2AQ9P2K1 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.93■■■■■ 4.14
CC2D2AQ9P2K1 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.93■■■■■ 4.14
CC2D2AQ9P2K1 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC40.93■■■■■ 4.14
CC2D2AQ9P2K1 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.92■■■■■ 4.14
CC2D2AQ9P2K1 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC40.92■■■■■ 4.14
CC2D2AQ9P2K1 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.92■■■■■ 4.14
CC2D2AQ9P2K1 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC40.92■■■■■ 4.14
CC2D2AQ9P2K1 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.92■■■■■ 4.14
CC2D2AQ9P2K1 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.92■■■■■ 4.14
CC2D2AQ9P2K1 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.92■■■■■ 4.14
CC2D2AQ9P2K1 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.92■■■■■ 4.14
CC2D2AQ9P2K1 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.92■■■■■ 4.14
CC2D2AQ9P2K1 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC40.92■■■■■ 4.14
CC2D2AQ9P2K1 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.91■■■■■ 4.14
CC2D2AQ9P2K1 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC40.9■■■■■ 4.14
CC2D2AQ9P2K1 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC40.9■■■■■ 4.14
CC2D2AQ9P2K1 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC40.9■■■■■ 4.14
CC2D2AQ9P2K1 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.9■■■■■ 4.14
CC2D2AQ9P2K1 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.89■■■■■ 4.14
CC2D2AQ9P2K1 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.89■■■■■ 4.14
CC2D2AQ9P2K1 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC40.89■■■■■ 4.14
CC2D2AQ9P2K1 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC40.89■■■■■ 4.14
CC2D2AQ9P2K1 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC40.89■■■■■ 4.14
CC2D2AQ9P2K1 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.89■■■■■ 4.14
CC2D2AQ9P2K1 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC40.89■■■■■ 4.14
CC2D2AQ9P2K1 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC40.89■■■■■ 4.14
CC2D2AQ9P2K1 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC40.89■■■■■ 4.14
CC2D2AQ9P2K1 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC40.89■■■■■ 4.14
CC2D2AQ9P2K1 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.88■■■■■ 4.13
CC2D2AQ9P2K1 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.88■■■■■ 4.13
CC2D2AQ9P2K1 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC40.88■■■■■ 4.13
CC2D2AQ9P2K1 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC40.88■■■■■ 4.13
CC2D2AQ9P2K1 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC40.87■■■■■ 4.13
CC2D2AQ9P2K1 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC40.87■■■■■ 4.13
CC2D2AQ9P2K1 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC40.87■■■■■ 4.13
CC2D2AQ9P2K1 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC40.87■■■■■ 4.13
CC2D2AQ9P2K1 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC40.87■■■■■ 4.13
CC2D2AQ9P2K1 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC40.87■■■■■ 4.13
CC2D2AQ9P2K1 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC40.86■■■■■ 4.13
CC2D2AQ9P2K1 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC40.86■■■■■ 4.13
CC2D2AQ9P2K1 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC40.86■■■■■ 4.13
CC2D2AQ9P2K1 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.86■■■■■ 4.13
CC2D2AQ9P2K1 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC40.85■■■■■ 4.13
CC2D2AQ9P2K1 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC40.85■■■■■ 4.13
CC2D2AQ9P2K1 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC40.85■■■■■ 4.13
CC2D2AQ9P2K1 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC40.85■■■■■ 4.13
CC2D2AQ9P2K1 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC40.85■■■■■ 4.13
CC2D2AQ9P2K1 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.85■■■■■ 4.13
CC2D2AQ9P2K1 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.84■■■■■ 4.13
CC2D2AQ9P2K1 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.84■■■■■ 4.13
CC2D2AQ9P2K1 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC40.84■■■■■ 4.13
CC2D2AQ9P2K1 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.84■■■■■ 4.13
CC2D2AQ9P2K1 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC40.84■■■■■ 4.13
CC2D2AQ9P2K1 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC40.84■■■■■ 4.13
CC2D2AQ9P2K1 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.84■■■■■ 4.13
CC2D2AQ9P2K1 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.84■■■■■ 4.13
CC2D2AQ9P2K1 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC40.84■■■■■ 4.13
CC2D2AQ9P2K1 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40.84■■■■■ 4.13
CC2D2AQ9P2K1 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.84■■■■■ 4.13
CC2D2AQ9P2K1 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC40.84■■■■■ 4.13
CC2D2AQ9P2K1 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC40.83■■■■■ 4.13
CC2D2AQ9P2K1 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.83■■■■■ 4.13
CC2D2AQ9P2K1 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC40.82■■■■■ 4.13
CC2D2AQ9P2K1 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.82■■■■■ 4.13
CC2D2AQ9P2K1 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC40.82■■■■■ 4.13
CC2D2AQ9P2K1 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.82■■■■■ 4.13
CC2D2AQ9P2K1 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC40.82■■■■■ 4.13
CC2D2AQ9P2K1 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.82■■■■■ 4.13
CC2D2AQ9P2K1 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.82■■■■■ 4.13
CC2D2AQ9P2K1 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC40.82■■■■■ 4.13
CC2D2AQ9P2K1 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.82■■■■■ 4.13
CC2D2AQ9P2K1 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC40.82■■■■■ 4.12
CC2D2AQ9P2K1 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC40.82■■■■■ 4.12
CC2D2AQ9P2K1 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.81■■■■■ 4.12
CC2D2AQ9P2K1 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC40.81■■■■■ 4.12
CC2D2AQ9P2K1 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.81■■■■■ 4.12
CC2D2AQ9P2K1 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC40.81■■■■■ 4.12
CC2D2AQ9P2K1 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.8■■■■■ 4.12
CC2D2AQ9P2K1 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC40.8■■■■■ 4.12
CC2D2AQ9P2K1 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC40.8■■■■■ 4.12
CC2D2AQ9P2K1 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC40.8■■■■■ 4.12
CC2D2AQ9P2K1 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC40.8■■■■■ 4.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms