Protein–RNA interactions for Protein: Q9P299

COPZ2, Coatomer subunit zeta-2, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPZ2Q9P299 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
COPZ2Q9P299 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
COPZ2Q9P299 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
COPZ2Q9P299 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
COPZ2Q9P299 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
COPZ2Q9P299 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
COPZ2Q9P299 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
COPZ2Q9P299 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
COPZ2Q9P299 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
COPZ2Q9P299 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
COPZ2Q9P299 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
COPZ2Q9P299 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
COPZ2Q9P299 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
COPZ2Q9P299 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
COPZ2Q9P299 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
COPZ2Q9P299 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
COPZ2Q9P299 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
COPZ2Q9P299 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
COPZ2Q9P299 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
COPZ2Q9P299 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
COPZ2Q9P299 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
COPZ2Q9P299 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
COPZ2Q9P299 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
COPZ2Q9P299 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
COPZ2Q9P299 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
COPZ2Q9P299 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
COPZ2Q9P299 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
COPZ2Q9P299 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
COPZ2Q9P299 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
COPZ2Q9P299 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
COPZ2Q9P299 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
COPZ2Q9P299 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
COPZ2Q9P299 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
COPZ2Q9P299 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
COPZ2Q9P299 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
COPZ2Q9P299 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
COPZ2Q9P299 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
COPZ2Q9P299 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
COPZ2Q9P299 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
COPZ2Q9P299 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
COPZ2Q9P299 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
COPZ2Q9P299 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
COPZ2Q9P299 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
COPZ2Q9P299 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
COPZ2Q9P299 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
COPZ2Q9P299 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
COPZ2Q9P299 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
COPZ2Q9P299 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
COPZ2Q9P299 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
COPZ2Q9P299 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
COPZ2Q9P299 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
COPZ2Q9P299 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
COPZ2Q9P299 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
COPZ2Q9P299 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
COPZ2Q9P299 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
COPZ2Q9P299 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
COPZ2Q9P299 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
COPZ2Q9P299 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
COPZ2Q9P299 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
COPZ2Q9P299 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
COPZ2Q9P299 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
COPZ2Q9P299 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
COPZ2Q9P299 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
COPZ2Q9P299 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
COPZ2Q9P299 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
COPZ2Q9P299 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
COPZ2Q9P299 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
COPZ2Q9P299 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
COPZ2Q9P299 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
COPZ2Q9P299 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
COPZ2Q9P299 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
COPZ2Q9P299 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
COPZ2Q9P299 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
COPZ2Q9P299 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
COPZ2Q9P299 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
COPZ2Q9P299 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
COPZ2Q9P299 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
COPZ2Q9P299 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
COPZ2Q9P299 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
COPZ2Q9P299 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
COPZ2Q9P299 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
COPZ2Q9P299 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
COPZ2Q9P299 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
COPZ2Q9P299 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
COPZ2Q9P299 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
COPZ2Q9P299 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
COPZ2Q9P299 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
COPZ2Q9P299 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
COPZ2Q9P299 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
COPZ2Q9P299 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
COPZ2Q9P299 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
COPZ2Q9P299 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
COPZ2Q9P299 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
COPZ2Q9P299 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
COPZ2Q9P299 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
COPZ2Q9P299 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
COPZ2Q9P299 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
COPZ2Q9P299 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
COPZ2Q9P299 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
COPZ2Q9P299 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms