Protein–RNA interactions for Protein: Q9P275

USP36, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 36, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP36Q9P275 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
USP36Q9P275 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP36Q9P275 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP36Q9P275 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP36Q9P275 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP36Q9P275 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP36Q9P275 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP36Q9P275 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP36Q9P275 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP36Q9P275 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP36Q9P275 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP36Q9P275 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP36Q9P275 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP36Q9P275 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP36Q9P275 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP36Q9P275 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP36Q9P275 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP36Q9P275 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP36Q9P275 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP36Q9P275 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP36Q9P275 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP36Q9P275 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP36Q9P275 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP36Q9P275 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
USP36Q9P275 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP36Q9P275 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP36Q9P275 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP36Q9P275 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP36Q9P275 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP36Q9P275 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP36Q9P275 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP36Q9P275 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP36Q9P275 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP36Q9P275 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP36Q9P275 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP36Q9P275 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
USP36Q9P275 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP36Q9P275 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP36Q9P275 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP36Q9P275 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP36Q9P275 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP36Q9P275 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP36Q9P275 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP36Q9P275 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP36Q9P275 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP36Q9P275 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
USP36Q9P275 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP36Q9P275 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP36Q9P275 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
USP36Q9P275 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP36Q9P275 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP36Q9P275 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP36Q9P275 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP36Q9P275 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP36Q9P275 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP36Q9P275 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP36Q9P275 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP36Q9P275 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
USP36Q9P275 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP36Q9P275 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP36Q9P275 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP36Q9P275 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP36Q9P275 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
USP36Q9P275 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
USP36Q9P275 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
USP36Q9P275 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP36Q9P275 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP36Q9P275 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP36Q9P275 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP36Q9P275 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP36Q9P275 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP36Q9P275 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP36Q9P275 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP36Q9P275 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP36Q9P275 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP36Q9P275 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP36Q9P275 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP36Q9P275 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP36Q9P275 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP36Q9P275 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP36Q9P275 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP36Q9P275 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP36Q9P275 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP36Q9P275 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP36Q9P275 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP36Q9P275 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP36Q9P275 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP36Q9P275 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP36Q9P275 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP36Q9P275 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
USP36Q9P275 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP36Q9P275 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP36Q9P275 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
USP36Q9P275 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP36Q9P275 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP36Q9P275 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP36Q9P275 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP36Q9P275 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP36Q9P275 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP36Q9P275 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms