Protein–RNA interactions for Protein: Q9P219

CCDC88C, Protein Daple, humanhuman

Predictions only

Length 2,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC88CQ9P219 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC88CQ9P219 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC88CQ9P219 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC88CQ9P219 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CCDC88CQ9P219 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CCDC88CQ9P219 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC88CQ9P219 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC88CQ9P219 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC88CQ9P219 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC88CQ9P219 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC88CQ9P219 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC88CQ9P219 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC88CQ9P219 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC88CQ9P219 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC88CQ9P219 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC88CQ9P219 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC88CQ9P219 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CCDC88CQ9P219 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC88CQ9P219 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CCDC88CQ9P219 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CCDC88CQ9P219 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC88CQ9P219 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC88CQ9P219 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC88CQ9P219 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC88CQ9P219 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC88CQ9P219 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC88CQ9P219 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC88CQ9P219 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC88CQ9P219 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC88CQ9P219 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC88CQ9P219 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC88CQ9P219 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC88CQ9P219 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC88CQ9P219 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC88CQ9P219 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC88CQ9P219 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC88CQ9P219 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC88CQ9P219 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC88CQ9P219 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC88CQ9P219 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC88CQ9P219 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC88CQ9P219 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC88CQ9P219 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC88CQ9P219 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC88CQ9P219 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CCDC88CQ9P219 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CCDC88CQ9P219 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CCDC88CQ9P219 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC88CQ9P219 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC88CQ9P219 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC88CQ9P219 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC88CQ9P219 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC88CQ9P219 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC88CQ9P219 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC88CQ9P219 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC88CQ9P219 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC88CQ9P219 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC88CQ9P219 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC88CQ9P219 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC88CQ9P219 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC88CQ9P219 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC88CQ9P219 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC88CQ9P219 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC88CQ9P219 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC88CQ9P219 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC88CQ9P219 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC88CQ9P219 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC88CQ9P219 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC88CQ9P219 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC88CQ9P219 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC88CQ9P219 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC88CQ9P219 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC88CQ9P219 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC88CQ9P219 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC88CQ9P219 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC88CQ9P219 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC88CQ9P219 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC88CQ9P219 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC88CQ9P219 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC88CQ9P219 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC88CQ9P219 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC88CQ9P219 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC88CQ9P219 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC88CQ9P219 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC88CQ9P219 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC88CQ9P219 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC88CQ9P219 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC88CQ9P219 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC88CQ9P219 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC88CQ9P219 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC88CQ9P219 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC88CQ9P219 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC88CQ9P219 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC88CQ9P219 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC88CQ9P219 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC88CQ9P219 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC88CQ9P219 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC88CQ9P219 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC88CQ9P219 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC88CQ9P219 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms