Protein–RNA interactions for Protein: Q9P031

CCDC59, Thyroid transcription factor 1-associated protein 26, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC59Q9P031 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CCDC59Q9P031 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CCDC59Q9P031 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CCDC59Q9P031 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CCDC59Q9P031 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CCDC59Q9P031 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CCDC59Q9P031 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
CCDC59Q9P031 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CCDC59Q9P031 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CCDC59Q9P031 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CCDC59Q9P031 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CCDC59Q9P031 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CCDC59Q9P031 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CCDC59Q9P031 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
CCDC59Q9P031 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CCDC59Q9P031 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CCDC59Q9P031 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CCDC59Q9P031 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CCDC59Q9P031 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CCDC59Q9P031 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CCDC59Q9P031 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CCDC59Q9P031 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CCDC59Q9P031 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CCDC59Q9P031 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC19.77■□□□□ 0.75
CCDC59Q9P031 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.75
CCDC59Q9P031 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
CCDC59Q9P031 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CCDC59Q9P031 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CCDC59Q9P031 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CCDC59Q9P031 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CCDC59Q9P031 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CCDC59Q9P031 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CCDC59Q9P031 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CCDC59Q9P031 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
CCDC59Q9P031 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CCDC59Q9P031 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CCDC59Q9P031 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CCDC59Q9P031 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CCDC59Q9P031 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CCDC59Q9P031 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CCDC59Q9P031 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CCDC59Q9P031 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CCDC59Q9P031 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CCDC59Q9P031 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CCDC59Q9P031 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CCDC59Q9P031 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CCDC59Q9P031 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CCDC59Q9P031 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CCDC59Q9P031 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CCDC59Q9P031 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
CCDC59Q9P031 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CCDC59Q9P031 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CCDC59Q9P031 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CCDC59Q9P031 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CCDC59Q9P031 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CCDC59Q9P031 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CCDC59Q9P031 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CCDC59Q9P031 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CCDC59Q9P031 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CCDC59Q9P031 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CCDC59Q9P031 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CCDC59Q9P031 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CCDC59Q9P031 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CCDC59Q9P031 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CCDC59Q9P031 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CCDC59Q9P031 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CCDC59Q9P031 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CCDC59Q9P031 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CCDC59Q9P031 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CCDC59Q9P031 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CCDC59Q9P031 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CCDC59Q9P031 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CCDC59Q9P031 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CCDC59Q9P031 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CCDC59Q9P031 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CCDC59Q9P031 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CCDC59Q9P031 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CCDC59Q9P031 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CCDC59Q9P031 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CCDC59Q9P031 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CCDC59Q9P031 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
CCDC59Q9P031 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CCDC59Q9P031 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CCDC59Q9P031 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CCDC59Q9P031 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CCDC59Q9P031 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CCDC59Q9P031 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CCDC59Q9P031 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CCDC59Q9P031 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CCDC59Q9P031 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CCDC59Q9P031 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CCDC59Q9P031 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CCDC59Q9P031 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CCDC59Q9P031 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CCDC59Q9P031 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CCDC59Q9P031 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CCDC59Q9P031 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CCDC59Q9P031 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
CCDC59Q9P031 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CCDC59Q9P031 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms