Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZV7

ZIM2, Zinc finger imprinted 2, humanhuman

Predictions only

Length 527 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIM2Q9NZV7 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZIM2Q9NZV7 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZIM2Q9NZV7 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZIM2Q9NZV7 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZIM2Q9NZV7 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZIM2Q9NZV7 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZIM2Q9NZV7 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZIM2Q9NZV7 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZIM2Q9NZV7 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZIM2Q9NZV7 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZIM2Q9NZV7 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZIM2Q9NZV7 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZIM2Q9NZV7 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZIM2Q9NZV7 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZIM2Q9NZV7 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZIM2Q9NZV7 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZIM2Q9NZV7 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZIM2Q9NZV7 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZIM2Q9NZV7 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZIM2Q9NZV7 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZIM2Q9NZV7 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZIM2Q9NZV7 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ZIM2Q9NZV7 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ZIM2Q9NZV7 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
ZIM2Q9NZV7 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ZIM2Q9NZV7 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.33■■□□□ 1
ZIM2Q9NZV7 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
ZIM2Q9NZV7 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
ZIM2Q9NZV7 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.32■■□□□ 1
ZIM2Q9NZV7 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ZIM2Q9NZV7 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ZIM2Q9NZV7 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ZIM2Q9NZV7 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ZIM2Q9NZV7 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ZIM2Q9NZV7 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZIM2Q9NZV7 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZIM2Q9NZV7 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZIM2Q9NZV7 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZIM2Q9NZV7 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZIM2Q9NZV7 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ZIM2Q9NZV7 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZIM2Q9NZV7 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZIM2Q9NZV7 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZIM2Q9NZV7 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZIM2Q9NZV7 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZIM2Q9NZV7 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC21.3■■□□□ 1
ZIM2Q9NZV7 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZIM2Q9NZV7 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZIM2Q9NZV7 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZIM2Q9NZV7 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC21.3■■□□□ 1
ZIM2Q9NZV7 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC21.3■■□□□ 1
ZIM2Q9NZV7 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ZIM2Q9NZV7 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ZIM2Q9NZV7 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZIM2Q9NZV7 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZIM2Q9NZV7 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZIM2Q9NZV7 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZIM2Q9NZV7 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZIM2Q9NZV7 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
ZIM2Q9NZV7 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ZIM2Q9NZV7 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZIM2Q9NZV7 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ZIM2Q9NZV7 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZIM2Q9NZV7 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ZIM2Q9NZV7 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZIM2Q9NZV7 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ZIM2Q9NZV7 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZIM2Q9NZV7 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
ZIM2Q9NZV7 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ZIM2Q9NZV7 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZIM2Q9NZV7 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ZIM2Q9NZV7 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZIM2Q9NZV7 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZIM2Q9NZV7 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
ZIM2Q9NZV7 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ZIM2Q9NZV7 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ZIM2Q9NZV7 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZIM2Q9NZV7 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZIM2Q9NZV7 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZIM2Q9NZV7 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ZIM2Q9NZV7 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ZIM2Q9NZV7 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZIM2Q9NZV7 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ZIM2Q9NZV7 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ZIM2Q9NZV7 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ZIM2Q9NZV7 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZIM2Q9NZV7 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZIM2Q9NZV7 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ZIM2Q9NZV7 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZIM2Q9NZV7 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ZIM2Q9NZV7 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ZIM2Q9NZV7 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZIM2Q9NZV7 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ZIM2Q9NZV7 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZIM2Q9NZV7 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZIM2Q9NZV7 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZIM2Q9NZV7 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZIM2Q9NZV7 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ZIM2Q9NZV7 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ZIM2Q9NZV7 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms