Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZ63

C9orf78, Telomere length and silencing protein 1 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf78Q9NZ63 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
C9orf78Q9NZ63 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
C9orf78Q9NZ63 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
C9orf78Q9NZ63 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
C9orf78Q9NZ63 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
C9orf78Q9NZ63 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
C9orf78Q9NZ63 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
C9orf78Q9NZ63 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
C9orf78Q9NZ63 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
C9orf78Q9NZ63 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
C9orf78Q9NZ63 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
C9orf78Q9NZ63 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
C9orf78Q9NZ63 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
C9orf78Q9NZ63 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
C9orf78Q9NZ63 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
C9orf78Q9NZ63 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
C9orf78Q9NZ63 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
C9orf78Q9NZ63 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
C9orf78Q9NZ63 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
C9orf78Q9NZ63 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
C9orf78Q9NZ63 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
C9orf78Q9NZ63 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
C9orf78Q9NZ63 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
C9orf78Q9NZ63 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
C9orf78Q9NZ63 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
C9orf78Q9NZ63 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
C9orf78Q9NZ63 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
C9orf78Q9NZ63 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
C9orf78Q9NZ63 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
C9orf78Q9NZ63 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
C9orf78Q9NZ63 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
C9orf78Q9NZ63 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
C9orf78Q9NZ63 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
C9orf78Q9NZ63 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
C9orf78Q9NZ63 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
C9orf78Q9NZ63 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
C9orf78Q9NZ63 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
C9orf78Q9NZ63 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
C9orf78Q9NZ63 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
C9orf78Q9NZ63 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC28.02■■■□□ 2.08
C9orf78Q9NZ63 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
C9orf78Q9NZ63 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
C9orf78Q9NZ63 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
C9orf78Q9NZ63 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
C9orf78Q9NZ63 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
C9orf78Q9NZ63 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
C9orf78Q9NZ63 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
C9orf78Q9NZ63 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
C9orf78Q9NZ63 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
C9orf78Q9NZ63 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
C9orf78Q9NZ63 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
C9orf78Q9NZ63 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
C9orf78Q9NZ63 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
C9orf78Q9NZ63 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
C9orf78Q9NZ63 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
C9orf78Q9NZ63 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
C9orf78Q9NZ63 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
C9orf78Q9NZ63 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
C9orf78Q9NZ63 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
C9orf78Q9NZ63 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
C9orf78Q9NZ63 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
C9orf78Q9NZ63 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
C9orf78Q9NZ63 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
C9orf78Q9NZ63 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
C9orf78Q9NZ63 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
C9orf78Q9NZ63 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
C9orf78Q9NZ63 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
C9orf78Q9NZ63 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
C9orf78Q9NZ63 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
C9orf78Q9NZ63 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
C9orf78Q9NZ63 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
C9orf78Q9NZ63 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
C9orf78Q9NZ63 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
C9orf78Q9NZ63 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
C9orf78Q9NZ63 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
C9orf78Q9NZ63 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
C9orf78Q9NZ63 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
C9orf78Q9NZ63 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
C9orf78Q9NZ63 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
C9orf78Q9NZ63 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
C9orf78Q9NZ63 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
C9orf78Q9NZ63 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
C9orf78Q9NZ63 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
C9orf78Q9NZ63 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
C9orf78Q9NZ63 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
C9orf78Q9NZ63 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
C9orf78Q9NZ63 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
C9orf78Q9NZ63 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
C9orf78Q9NZ63 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
C9orf78Q9NZ63 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
C9orf78Q9NZ63 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
C9orf78Q9NZ63 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
C9orf78Q9NZ63 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
C9orf78Q9NZ63 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
C9orf78Q9NZ63 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
C9orf78Q9NZ63 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
C9orf78Q9NZ63 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
C9orf78Q9NZ63 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
C9orf78Q9NZ63 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
C9orf78Q9NZ63 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms