Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY61

AATF, Protein AATF, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 560 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AATFQ9NY61 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.373e-6■■■□□ 18.2
AATFQ9NY61 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.362e-7■■■□□ 18.2
AATFQ9NY61 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.353e-6■■■□□ 18.2
AATFQ9NY61 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.333e-6■■■□□ 18.2
AATFQ9NY61 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.323e-6■■■□□ 18.2
AATFQ9NY61 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.292e-7■■■□□ 18.2
AATFQ9NY61 SURF4-203ENST00000371991 715 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.222e-7■■■□□ 18.2
AATFQ9NY61 STK11-203ENST00000585748 746 ntTSL 316.27■□□□□ 0.22e-7■■■□□ 18.2
AATFQ9NY61 AC131212.3-201ENST00000624087 4219 ntBASIC16.14■□□□□ 0.173e-6■■■□□ 18.2
AATFQ9NY61 SURF4-205ENST00000467910 693 ntTSL 516■□□□□ 0.152e-7■■■□□ 18.2
AATFQ9NY61 HNRNPDL-207ENST00000614627 3968 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.143e-6■■■□□ 18.2
AATFQ9NY61 ARID4B-201ENST00000264183 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.052e-7■■■□□ 18.2
AATFQ9NY61 EIF4H-204ENST00000489484 831 ntTSL 215.38■□□□□ 0.052e-7■■■□□ 18.2
AATFQ9NY61 PAX8-AS1-219ENST00000623306 840 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.022e-7■■■□□ 18.2
AATFQ9NY61 TBC1D14-208ENST00000451522 4149 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.023e-6■■■□□ 18.2
AATFQ9NY61 YWHAZ-206ENST00000395957 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.093e-11■■■□□ 18.2
AATFQ9NY61 ARID4B-205ENST00000421364 5151 ntTSL 1 (best)14.03□□□□□ -0.162e-7■■■□□ 18.2
AATFQ9NY61 PAX8-AS1-217ENST00000617509 627 ntTSL 4 BASIC13.99□□□□□ -0.172e-7■■■□□ 18.2
AATFQ9NY61 SOGA1-201ENST00000237536 14371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.23e-6■■■□□ 18.2
AATFQ9NY61 PAX8-AS1-205ENST00000437551 2390 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.222e-7■■■□□ 18.2
AATFQ9NY61 TBC1D14-201ENST00000409757 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.233e-6■■■□□ 18.2
AATFQ9NY61 SNIP1-201ENST00000296215 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.273e-6■■■□□ 18.2
AATFQ9NY61 YWHAZ-207ENST00000395958 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.293e-11■■■□□ 18.2
AATFQ9NY61 YWHAZ-216ENST00000521309 1399 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.33e-11■■■□□ 18.2
AATFQ9NY61 ARID4B-212ENST00000491632 3823 ntTSL 1 (best)13.09□□□□□ -0.312e-7■■■□□ 18.2
AATFQ9NY61 YWHAZ-217ENST00000521328 511 ntTSL 512.7□□□□□ -0.383e-11■■■□□ 18.2
AATFQ9NY61 TMEM161B-AS1-207ENST00000506584 717 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.423e-11■■■□□ 18.2
AATFQ9NY61 PAX8-AS1-207ENST00000451179 1196 ntTSL 1 (best)12.3□□□□□ -0.442e-7■■■□□ 18.2
AATFQ9NY61 YWHAZ-212ENST00000480304 2247 ntTSL 212.12□□□□□ -0.473e-11■■■□□ 18.2
AATFQ9NY61 TBC1D14-207ENST00000448507 4887 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.523e-6■■■□□ 18.2
AATFQ9NY61 CUX1-216ENST00000558469 588 ntTSL 411.56□□□□□ -0.563e-6■■■□□ 18.2
AATFQ9NY61 TBC1D14-202ENST00000410031 4201 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.573e-6■■■□□ 18.2
AATFQ9NY61 PAX8-AS1-215ENST00000616073 512 ntTSL 411.4□□□□□ -0.582e-7■■■□□ 18.2
AATFQ9NY61 SMPD4P1-203ENST00000443839 2108 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.63e-6■■■□□ 18.2
AATFQ9NY61 YWHAZ-202ENST00000395948 812 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.643e-11■■■□□ 18.2
AATFQ9NY61 TBC1D14-206ENST00000446947 4021 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.643e-6■■■□□ 18.2
AATFQ9NY61 DDHD2-218ENST00000529642 358 ntTSL 510.4□□□□□ -0.743e-6■■■□□ 18.2
AATFQ9NY61 DDHD2-212ENST00000527834 568 ntTSL 410.4□□□□□ -0.743e-6■■■□□ 18.2
AATFQ9NY61 CUX1-201ENST00000292535 13747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.773e-6■■■□□ 18.2
AATFQ9NY61 PAX8-AS1-208ENST00000456685 1207 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.832e-7■■■□□ 18.2
AATFQ9NY61 PAX8-AS1-201ENST00000333145 2319 ntTSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.852e-7■■■□□ 18.2
AATFQ9NY61 DDHD2-223ENST00000532222 696 ntTSL 59.48□□□□□ -0.893e-6■■■□□ 18.2
AATFQ9NY61 PAX8-AS1-210ENST00000553869 560 ntTSL 59.42□□□□□ -0.92e-7■■■□□ 18.2
AATFQ9NY61 TMEM161B-AS1-201ENST00000496733 409 ntTSL 39.4□□□□□ -0.93e-11■■■□□ 18.2
AATFQ9NY61 WDR43-205ENST00000446643 579 ntTSL 49.38□□□□□ -0.913e-6■■■□□ 18.2
AATFQ9NY61 PAX8-AS1-202ENST00000422956 11799 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.172e-7■■■□□ 18.2
AATFQ9NY61 PAX8-AS1-212ENST00000556070 567 ntTSL 46.48□□□□□ -1.372e-7■■■□□ 18.2
AATFQ9NY61 TMEM161B-AS1-208ENST00000507736 630 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.53e-11■■■□□ 18.2
AATFQ9NY61 TMEM161B-AS1-211ENST00000512724 570 ntTSL 35.61□□□□□ -1.513e-11■■■□□ 18.2
AATFQ9NY61 EIF4H-203ENST00000479338 573 ntTSL 25.18□□□□□ -1.582e-7■■■□□ 18.2
AATFQ9NY61 PAX8-AS1-220ENST00000624706 434 ntTSL 54.61□□□□□ -1.672e-7■■■□□ 18.2
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AATFQ9NY61 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.392e-6■■■□□ 18.1
AATFQ9NY61 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.022e-6■■■□□ 18.1
AATFQ9NY61 TRIB3-203ENST00000449710 1070 ntTSL 520.94■□□□□ 0.942e-6■■■□□ 18.1
AATFQ9NY61 TRIB3-204ENST00000615226 877 ntTSL 36.34□□□□□ -1.392e-6■■■□□ 18.1
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AATFQ9NY61 RACK1-230ENST00000513060 1651 ntTSL 516.4■□□□□ 0.222e-19■■■□□ 18.1
AATFQ9NY61 RACK1-202ENST00000502548 1090 ntTSL 1 (best)15.78■□□□□ 0.122e-19■■■□□ 18.1
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AATFQ9NY61 RACK1-227ENST00000512805 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.412e-19■■■□□ 18.1
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AATFQ9NY61 RACK1-210ENST00000504325 1098 ntTSL 1 (best)11.33□□□□□ -0.62e-19■■■□□ 18.1
AATFQ9NY61 RACK1-228ENST00000512968 1058 ntTSL 511.22□□□□□ -0.612e-19■■■□□ 18.1
AATFQ9NY61 RACK1-208ENST00000503494 843 ntTSL 311.03□□□□□ -0.642e-19■■■□□ 18.1
AATFQ9NY61 RACK1-211ENST00000504726 388 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.722e-19■■■□□ 18.1
AATFQ9NY61 RACK1-201ENST00000376817 965 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.772e-19■■■□□ 18.1
AATFQ9NY61 RACK1-215ENST00000507261 590 ntTSL 310.22□□□□□ -0.772e-19■■■□□ 18.1
AATFQ9NY61 RACK1-206ENST00000503081 587 ntTSL 39.81□□□□□ -0.842e-19■■■□□ 18.1
AATFQ9NY61 RACK1-213ENST00000506312 559 ntTSL 59.77□□□□□ -0.852e-19■■■□□ 18.1
AATFQ9NY61 RACK1-214ENST00000507000 685 ntTSL 58.58□□□□□ -1.042e-19■■■□□ 18.1
AATFQ9NY61 RACK1-235ENST00000626067 564 ntTSL 2 BASIC8□□□□□ -1.132e-19■■■□□ 18.1
AATFQ9NY61 RACK1-231ENST00000514183 1439 ntTSL 27.79□□□□□ -1.162e-19■■■□□ 18.1
AATFQ9NY61 RACK1-220ENST00000508963 581 ntTSL 27.54□□□□□ -1.22e-19■■■□□ 18.1
AATFQ9NY61 RN7SKP203-201ENST00000363618 332 ntBASIC16.07■□□□□ 0.161e-323■■■□□ 18
AATFQ9NY61 ARID3A-205ENST00000587532 1016 ntTSL 522.55■■□□□ 1.29e-7■■■□□ 18
AATFQ9NY61 ARID3A-202ENST00000457152 549 ntTSL 516.21■□□□□ 0.199e-7■■■□□ 18
AATFQ9NY61 NOL4L-209ENST00000485364 885 ntTSL 1 (best)29.37■■■□□ 2.294e-8■■■□□ 18
AATFQ9NY61 NOL4L-201ENST00000201961 971 ntAPPRIS ALT2 TSL 329.03■■■□□ 2.244e-8■■■□□ 18
AATFQ9NY61 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.644e-8■■■□□ 18
AATFQ9NY61 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.272e-6■■■□□ 18
AATFQ9NY61 HNRNPA2B1-203ENST00000360787 1724 ntTSL 517.18■□□□□ 0.344e-49■■■□□ 17.9
AATFQ9NY61 HNRNPA2B1-206ENST00000490912 5328 ntTSL 216.91■□□□□ 0.34e-49■■■□□ 17.9
AATFQ9NY61 HNRNPA2B1-204ENST00000463181 6284 ntTSL 215.54■□□□□ 0.084e-49■■■□□ 17.9
AATFQ9NY61 HNRNPA2B1-202ENST00000356674 1711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.124e-49■■■□□ 17.9
AATFQ9NY61 HNRNPA2B1-208ENST00000618183 3539 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.44e-49■■■□□ 17.9
AATFQ9NY61 HNRNPA2B1-201ENST00000354667 3664 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.94e-49■■■□□ 17.9
AATFQ9NY61 RN7SKP71-201ENST00000364558 318 ntBASIC16.07■□□□□ 0.168e-6■■■□□ 17.9
AATFQ9NY61 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.52e-6■■■□□ 17.9
AATFQ9NY61 CDC42-202ENST00000344548 2256 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.162e-6■■■□□ 17.9
AATFQ9NY61 CDC42-201ENST00000315554 1452 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.882e-6■■■□□ 17.9
AATFQ9NY61 CDC42-205ENST00000498236 816 ntTSL 59.01□□□□□ -0.972e-6■■■□□ 17.9
AATFQ9NY61 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.789e-7■■■□□ 17.9
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