Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXR1

NDE1, Nuclear distribution protein nudE homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDE1Q9NXR1 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NDE1Q9NXR1 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NDE1Q9NXR1 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NDE1Q9NXR1 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NDE1Q9NXR1 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NDE1Q9NXR1 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NDE1Q9NXR1 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NDE1Q9NXR1 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NDE1Q9NXR1 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NDE1Q9NXR1 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NDE1Q9NXR1 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NDE1Q9NXR1 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
NDE1Q9NXR1 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NDE1Q9NXR1 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NDE1Q9NXR1 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NDE1Q9NXR1 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NDE1Q9NXR1 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NDE1Q9NXR1 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NDE1Q9NXR1 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NDE1Q9NXR1 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NDE1Q9NXR1 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
NDE1Q9NXR1 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
NDE1Q9NXR1 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NDE1Q9NXR1 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NDE1Q9NXR1 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NDE1Q9NXR1 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NDE1Q9NXR1 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NDE1Q9NXR1 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NDE1Q9NXR1 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NDE1Q9NXR1 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NDE1Q9NXR1 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NDE1Q9NXR1 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NDE1Q9NXR1 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NDE1Q9NXR1 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NDE1Q9NXR1 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
NDE1Q9NXR1 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NDE1Q9NXR1 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NDE1Q9NXR1 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NDE1Q9NXR1 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NDE1Q9NXR1 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NDE1Q9NXR1 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NDE1Q9NXR1 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NDE1Q9NXR1 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NDE1Q9NXR1 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NDE1Q9NXR1 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NDE1Q9NXR1 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NDE1Q9NXR1 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NDE1Q9NXR1 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
NDE1Q9NXR1 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
NDE1Q9NXR1 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NDE1Q9NXR1 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NDE1Q9NXR1 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NDE1Q9NXR1 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NDE1Q9NXR1 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NDE1Q9NXR1 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NDE1Q9NXR1 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NDE1Q9NXR1 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NDE1Q9NXR1 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NDE1Q9NXR1 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NDE1Q9NXR1 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
NDE1Q9NXR1 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NDE1Q9NXR1 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NDE1Q9NXR1 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NDE1Q9NXR1 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NDE1Q9NXR1 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NDE1Q9NXR1 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NDE1Q9NXR1 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NDE1Q9NXR1 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NDE1Q9NXR1 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NDE1Q9NXR1 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NDE1Q9NXR1 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NDE1Q9NXR1 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NDE1Q9NXR1 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NDE1Q9NXR1 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NDE1Q9NXR1 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NDE1Q9NXR1 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NDE1Q9NXR1 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NDE1Q9NXR1 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NDE1Q9NXR1 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NDE1Q9NXR1 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NDE1Q9NXR1 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NDE1Q9NXR1 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NDE1Q9NXR1 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NDE1Q9NXR1 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NDE1Q9NXR1 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NDE1Q9NXR1 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NDE1Q9NXR1 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NDE1Q9NXR1 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NDE1Q9NXR1 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NDE1Q9NXR1 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
NDE1Q9NXR1 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NDE1Q9NXR1 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NDE1Q9NXR1 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NDE1Q9NXR1 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NDE1Q9NXR1 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NDE1Q9NXR1 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NDE1Q9NXR1 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NDE1Q9NXR1 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NDE1Q9NXR1 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NDE1Q9NXR1 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms