Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXE8

CWC25, Pre-mRNA-splicing factor CWC25 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CWC25Q9NXE8 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CWC25Q9NXE8 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
CWC25Q9NXE8 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CWC25Q9NXE8 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CWC25Q9NXE8 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CWC25Q9NXE8 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CWC25Q9NXE8 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CWC25Q9NXE8 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CWC25Q9NXE8 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CWC25Q9NXE8 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CWC25Q9NXE8 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CWC25Q9NXE8 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CWC25Q9NXE8 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CWC25Q9NXE8 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CWC25Q9NXE8 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CWC25Q9NXE8 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CWC25Q9NXE8 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
CWC25Q9NXE8 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
CWC25Q9NXE8 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
CWC25Q9NXE8 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CWC25Q9NXE8 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CWC25Q9NXE8 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CWC25Q9NXE8 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CWC25Q9NXE8 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
CWC25Q9NXE8 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CWC25Q9NXE8 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CWC25Q9NXE8 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CWC25Q9NXE8 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
CWC25Q9NXE8 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CWC25Q9NXE8 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CWC25Q9NXE8 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
CWC25Q9NXE8 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CWC25Q9NXE8 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CWC25Q9NXE8 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
CWC25Q9NXE8 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CWC25Q9NXE8 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CWC25Q9NXE8 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CWC25Q9NXE8 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CWC25Q9NXE8 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CWC25Q9NXE8 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CWC25Q9NXE8 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CWC25Q9NXE8 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CWC25Q9NXE8 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CWC25Q9NXE8 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CWC25Q9NXE8 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CWC25Q9NXE8 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CWC25Q9NXE8 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CWC25Q9NXE8 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CWC25Q9NXE8 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CWC25Q9NXE8 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CWC25Q9NXE8 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CWC25Q9NXE8 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CWC25Q9NXE8 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CWC25Q9NXE8 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CWC25Q9NXE8 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CWC25Q9NXE8 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CWC25Q9NXE8 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CWC25Q9NXE8 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CWC25Q9NXE8 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CWC25Q9NXE8 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
CWC25Q9NXE8 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CWC25Q9NXE8 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CWC25Q9NXE8 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
CWC25Q9NXE8 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CWC25Q9NXE8 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
CWC25Q9NXE8 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC28■■■□□ 2.07
CWC25Q9NXE8 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
CWC25Q9NXE8 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CWC25Q9NXE8 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CWC25Q9NXE8 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CWC25Q9NXE8 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CWC25Q9NXE8 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CWC25Q9NXE8 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CWC25Q9NXE8 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CWC25Q9NXE8 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CWC25Q9NXE8 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CWC25Q9NXE8 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CWC25Q9NXE8 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CWC25Q9NXE8 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CWC25Q9NXE8 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CWC25Q9NXE8 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CWC25Q9NXE8 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CWC25Q9NXE8 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CWC25Q9NXE8 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CWC25Q9NXE8 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CWC25Q9NXE8 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CWC25Q9NXE8 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
CWC25Q9NXE8 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CWC25Q9NXE8 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CWC25Q9NXE8 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CWC25Q9NXE8 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CWC25Q9NXE8 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CWC25Q9NXE8 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CWC25Q9NXE8 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CWC25Q9NXE8 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CWC25Q9NXE8 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CWC25Q9NXE8 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CWC25Q9NXE8 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CWC25Q9NXE8 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CWC25Q9NXE8 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.1 ms