Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX57

RAB20, Ras-related protein Rab-20, humanhuman

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB20Q9NX57 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RAB20Q9NX57 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RAB20Q9NX57 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RAB20Q9NX57 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RAB20Q9NX57 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RAB20Q9NX57 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RAB20Q9NX57 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RAB20Q9NX57 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RAB20Q9NX57 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RAB20Q9NX57 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RAB20Q9NX57 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RAB20Q9NX57 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RAB20Q9NX57 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RAB20Q9NX57 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RAB20Q9NX57 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
RAB20Q9NX57 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RAB20Q9NX57 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RAB20Q9NX57 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
RAB20Q9NX57 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RAB20Q9NX57 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RAB20Q9NX57 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RAB20Q9NX57 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RAB20Q9NX57 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RAB20Q9NX57 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RAB20Q9NX57 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RAB20Q9NX57 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RAB20Q9NX57 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RAB20Q9NX57 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RAB20Q9NX57 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RAB20Q9NX57 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RAB20Q9NX57 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RAB20Q9NX57 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
RAB20Q9NX57 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RAB20Q9NX57 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RAB20Q9NX57 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RAB20Q9NX57 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RAB20Q9NX57 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
RAB20Q9NX57 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RAB20Q9NX57 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RAB20Q9NX57 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RAB20Q9NX57 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RAB20Q9NX57 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RAB20Q9NX57 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RAB20Q9NX57 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RAB20Q9NX57 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RAB20Q9NX57 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RAB20Q9NX57 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RAB20Q9NX57 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RAB20Q9NX57 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RAB20Q9NX57 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RAB20Q9NX57 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RAB20Q9NX57 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RAB20Q9NX57 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RAB20Q9NX57 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RAB20Q9NX57 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RAB20Q9NX57 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RAB20Q9NX57 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RAB20Q9NX57 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RAB20Q9NX57 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RAB20Q9NX57 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RAB20Q9NX57 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RAB20Q9NX57 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RAB20Q9NX57 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RAB20Q9NX57 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RAB20Q9NX57 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RAB20Q9NX57 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RAB20Q9NX57 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RAB20Q9NX57 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RAB20Q9NX57 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RAB20Q9NX57 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RAB20Q9NX57 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RAB20Q9NX57 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RAB20Q9NX57 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RAB20Q9NX57 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RAB20Q9NX57 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RAB20Q9NX57 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RAB20Q9NX57 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RAB20Q9NX57 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RAB20Q9NX57 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RAB20Q9NX57 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RAB20Q9NX57 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RAB20Q9NX57 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RAB20Q9NX57 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RAB20Q9NX57 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RAB20Q9NX57 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RAB20Q9NX57 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RAB20Q9NX57 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RAB20Q9NX57 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RAB20Q9NX57 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RAB20Q9NX57 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RAB20Q9NX57 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RAB20Q9NX57 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RAB20Q9NX57 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RAB20Q9NX57 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RAB20Q9NX57 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RAB20Q9NX57 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RAB20Q9NX57 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RAB20Q9NX57 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RAB20Q9NX57 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RAB20Q9NX57 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms