Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWB7

IFT57, Intraflagellar transport protein 57 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT57Q9NWB7 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
IFT57Q9NWB7 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC29■■■□□ 2.23
IFT57Q9NWB7 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
IFT57Q9NWB7 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
IFT57Q9NWB7 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
IFT57Q9NWB7 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
IFT57Q9NWB7 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
IFT57Q9NWB7 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
IFT57Q9NWB7 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
IFT57Q9NWB7 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
IFT57Q9NWB7 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
IFT57Q9NWB7 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
IFT57Q9NWB7 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
IFT57Q9NWB7 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
IFT57Q9NWB7 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
IFT57Q9NWB7 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
IFT57Q9NWB7 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
IFT57Q9NWB7 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
IFT57Q9NWB7 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
IFT57Q9NWB7 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
IFT57Q9NWB7 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
IFT57Q9NWB7 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
IFT57Q9NWB7 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
IFT57Q9NWB7 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
IFT57Q9NWB7 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
IFT57Q9NWB7 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
IFT57Q9NWB7 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
IFT57Q9NWB7 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
IFT57Q9NWB7 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
IFT57Q9NWB7 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
IFT57Q9NWB7 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
IFT57Q9NWB7 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
IFT57Q9NWB7 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
IFT57Q9NWB7 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
IFT57Q9NWB7 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
IFT57Q9NWB7 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
IFT57Q9NWB7 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
IFT57Q9NWB7 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
IFT57Q9NWB7 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
IFT57Q9NWB7 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.96■■■□□ 2.23
IFT57Q9NWB7 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
IFT57Q9NWB7 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
IFT57Q9NWB7 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
IFT57Q9NWB7 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
IFT57Q9NWB7 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
IFT57Q9NWB7 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
IFT57Q9NWB7 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
IFT57Q9NWB7 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.23
IFT57Q9NWB7 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
IFT57Q9NWB7 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
IFT57Q9NWB7 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
IFT57Q9NWB7 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
IFT57Q9NWB7 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
IFT57Q9NWB7 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
IFT57Q9NWB7 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
IFT57Q9NWB7 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
IFT57Q9NWB7 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
IFT57Q9NWB7 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
IFT57Q9NWB7 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
IFT57Q9NWB7 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
IFT57Q9NWB7 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
IFT57Q9NWB7 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
IFT57Q9NWB7 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
IFT57Q9NWB7 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
IFT57Q9NWB7 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
IFT57Q9NWB7 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
IFT57Q9NWB7 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC28.93■■■□□ 2.22
IFT57Q9NWB7 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
IFT57Q9NWB7 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
IFT57Q9NWB7 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
IFT57Q9NWB7 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
IFT57Q9NWB7 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
IFT57Q9NWB7 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
IFT57Q9NWB7 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
IFT57Q9NWB7 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
IFT57Q9NWB7 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
IFT57Q9NWB7 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
IFT57Q9NWB7 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
IFT57Q9NWB7 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
IFT57Q9NWB7 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
IFT57Q9NWB7 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
IFT57Q9NWB7 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
IFT57Q9NWB7 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
IFT57Q9NWB7 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
IFT57Q9NWB7 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
IFT57Q9NWB7 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
IFT57Q9NWB7 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
IFT57Q9NWB7 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
IFT57Q9NWB7 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
IFT57Q9NWB7 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
IFT57Q9NWB7 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
IFT57Q9NWB7 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
IFT57Q9NWB7 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
IFT57Q9NWB7 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
IFT57Q9NWB7 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
IFT57Q9NWB7 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
IFT57Q9NWB7 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
IFT57Q9NWB7 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
IFT57Q9NWB7 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.21
IFT57Q9NWB7 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC28.89■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms