Protein–RNA interactions for Protein: Q9NW07

ZNF358, Zinc finger protein 358, humanhuman

Predictions only

Length 568 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF358Q9NW07 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF358Q9NW07 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF358Q9NW07 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF358Q9NW07 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF358Q9NW07 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF358Q9NW07 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF358Q9NW07 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF358Q9NW07 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF358Q9NW07 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF358Q9NW07 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF358Q9NW07 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF358Q9NW07 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF358Q9NW07 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF358Q9NW07 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF358Q9NW07 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF358Q9NW07 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF358Q9NW07 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF358Q9NW07 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF358Q9NW07 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF358Q9NW07 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF358Q9NW07 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF358Q9NW07 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF358Q9NW07 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF358Q9NW07 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF358Q9NW07 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF358Q9NW07 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF358Q9NW07 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF358Q9NW07 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF358Q9NW07 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF358Q9NW07 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF358Q9NW07 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF358Q9NW07 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF358Q9NW07 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF358Q9NW07 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF358Q9NW07 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF358Q9NW07 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF358Q9NW07 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF358Q9NW07 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF358Q9NW07 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF358Q9NW07 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF358Q9NW07 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF358Q9NW07 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF358Q9NW07 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF358Q9NW07 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF358Q9NW07 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF358Q9NW07 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF358Q9NW07 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF358Q9NW07 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF358Q9NW07 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF358Q9NW07 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF358Q9NW07 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF358Q9NW07 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF358Q9NW07 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF358Q9NW07 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF358Q9NW07 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF358Q9NW07 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF358Q9NW07 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF358Q9NW07 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF358Q9NW07 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF358Q9NW07 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF358Q9NW07 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF358Q9NW07 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF358Q9NW07 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF358Q9NW07 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF358Q9NW07 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF358Q9NW07 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNF358Q9NW07 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNF358Q9NW07 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNF358Q9NW07 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNF358Q9NW07 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNF358Q9NW07 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNF358Q9NW07 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNF358Q9NW07 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ZNF358Q9NW07 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
ZNF358Q9NW07 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF358Q9NW07 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF358Q9NW07 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF358Q9NW07 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF358Q9NW07 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF358Q9NW07 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF358Q9NW07 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF358Q9NW07 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF358Q9NW07 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF358Q9NW07 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF358Q9NW07 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF358Q9NW07 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF358Q9NW07 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF358Q9NW07 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF358Q9NW07 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF358Q9NW07 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF358Q9NW07 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF358Q9NW07 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF358Q9NW07 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF358Q9NW07 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF358Q9NW07 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF358Q9NW07 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF358Q9NW07 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF358Q9NW07 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF358Q9NW07 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF358Q9NW07 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms