Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVR0

KLHL11, Kelch-like protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL11Q9NVR0 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
KLHL11Q9NVR0 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
KLHL11Q9NVR0 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
KLHL11Q9NVR0 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
KLHL11Q9NVR0 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
KLHL11Q9NVR0 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KLHL11Q9NVR0 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
KLHL11Q9NVR0 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
KLHL11Q9NVR0 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
KLHL11Q9NVR0 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KLHL11Q9NVR0 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KLHL11Q9NVR0 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KLHL11Q9NVR0 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KLHL11Q9NVR0 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KLHL11Q9NVR0 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
KLHL11Q9NVR0 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KLHL11Q9NVR0 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
KLHL11Q9NVR0 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KLHL11Q9NVR0 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KLHL11Q9NVR0 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KLHL11Q9NVR0 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KLHL11Q9NVR0 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
KLHL11Q9NVR0 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KLHL11Q9NVR0 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KLHL11Q9NVR0 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
KLHL11Q9NVR0 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KLHL11Q9NVR0 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KLHL11Q9NVR0 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KLHL11Q9NVR0 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
KLHL11Q9NVR0 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KLHL11Q9NVR0 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KLHL11Q9NVR0 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KLHL11Q9NVR0 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KLHL11Q9NVR0 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KLHL11Q9NVR0 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KLHL11Q9NVR0 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KLHL11Q9NVR0 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KLHL11Q9NVR0 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KLHL11Q9NVR0 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KLHL11Q9NVR0 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KLHL11Q9NVR0 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KLHL11Q9NVR0 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
KLHL11Q9NVR0 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
KLHL11Q9NVR0 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KLHL11Q9NVR0 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KLHL11Q9NVR0 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KLHL11Q9NVR0 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KLHL11Q9NVR0 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KLHL11Q9NVR0 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KLHL11Q9NVR0 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KLHL11Q9NVR0 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KLHL11Q9NVR0 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KLHL11Q9NVR0 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KLHL11Q9NVR0 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KLHL11Q9NVR0 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KLHL11Q9NVR0 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
KLHL11Q9NVR0 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KLHL11Q9NVR0 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KLHL11Q9NVR0 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KLHL11Q9NVR0 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
KLHL11Q9NVR0 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KLHL11Q9NVR0 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KLHL11Q9NVR0 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KLHL11Q9NVR0 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KLHL11Q9NVR0 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
KLHL11Q9NVR0 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
KLHL11Q9NVR0 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
KLHL11Q9NVR0 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
KLHL11Q9NVR0 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
KLHL11Q9NVR0 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
KLHL11Q9NVR0 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
KLHL11Q9NVR0 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
KLHL11Q9NVR0 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
KLHL11Q9NVR0 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
KLHL11Q9NVR0 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
KLHL11Q9NVR0 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
KLHL11Q9NVR0 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
KLHL11Q9NVR0 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
KLHL11Q9NVR0 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
KLHL11Q9NVR0 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KLHL11Q9NVR0 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KLHL11Q9NVR0 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KLHL11Q9NVR0 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KLHL11Q9NVR0 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KLHL11Q9NVR0 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KLHL11Q9NVR0 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KLHL11Q9NVR0 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KLHL11Q9NVR0 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KLHL11Q9NVR0 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KLHL11Q9NVR0 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KLHL11Q9NVR0 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KLHL11Q9NVR0 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KLHL11Q9NVR0 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KLHL11Q9NVR0 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KLHL11Q9NVR0 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KLHL11Q9NVR0 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KLHL11Q9NVR0 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KLHL11Q9NVR0 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KLHL11Q9NVR0 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KLHL11Q9NVR0 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms