Protein–RNA interactions for Protein: Q9NV88

INTS9, Integrator complex subunit 9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 658 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INTS9Q9NV88 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
INTS9Q9NV88 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
INTS9Q9NV88 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
INTS9Q9NV88 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
INTS9Q9NV88 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
INTS9Q9NV88 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
INTS9Q9NV88 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
INTS9Q9NV88 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
INTS9Q9NV88 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
INTS9Q9NV88 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
INTS9Q9NV88 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
INTS9Q9NV88 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
INTS9Q9NV88 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
INTS9Q9NV88 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
INTS9Q9NV88 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
INTS9Q9NV88 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
INTS9Q9NV88 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
INTS9Q9NV88 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
INTS9Q9NV88 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
INTS9Q9NV88 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
INTS9Q9NV88 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
INTS9Q9NV88 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
INTS9Q9NV88 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
INTS9Q9NV88 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
INTS9Q9NV88 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
INTS9Q9NV88 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
INTS9Q9NV88 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
INTS9Q9NV88 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
INTS9Q9NV88 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
INTS9Q9NV88 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
INTS9Q9NV88 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
INTS9Q9NV88 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
INTS9Q9NV88 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
INTS9Q9NV88 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
INTS9Q9NV88 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
INTS9Q9NV88 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
INTS9Q9NV88 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
INTS9Q9NV88 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
INTS9Q9NV88 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
INTS9Q9NV88 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
INTS9Q9NV88 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
INTS9Q9NV88 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
INTS9Q9NV88 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
INTS9Q9NV88 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
INTS9Q9NV88 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
INTS9Q9NV88 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
INTS9Q9NV88 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
INTS9Q9NV88 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
INTS9Q9NV88 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
INTS9Q9NV88 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
INTS9Q9NV88 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
INTS9Q9NV88 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
INTS9Q9NV88 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
INTS9Q9NV88 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
INTS9Q9NV88 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
INTS9Q9NV88 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
INTS9Q9NV88 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
INTS9Q9NV88 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
INTS9Q9NV88 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
INTS9Q9NV88 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
INTS9Q9NV88 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
INTS9Q9NV88 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
INTS9Q9NV88 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
INTS9Q9NV88 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
INTS9Q9NV88 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
INTS9Q9NV88 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
INTS9Q9NV88 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
INTS9Q9NV88 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
INTS9Q9NV88 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
INTS9Q9NV88 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
INTS9Q9NV88 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
INTS9Q9NV88 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
INTS9Q9NV88 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
INTS9Q9NV88 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
INTS9Q9NV88 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
INTS9Q9NV88 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
INTS9Q9NV88 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
INTS9Q9NV88 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
INTS9Q9NV88 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
INTS9Q9NV88 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
INTS9Q9NV88 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
INTS9Q9NV88 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
INTS9Q9NV88 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
INTS9Q9NV88 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
INTS9Q9NV88 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
INTS9Q9NV88 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
INTS9Q9NV88 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
INTS9Q9NV88 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
INTS9Q9NV88 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
INTS9Q9NV88 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
INTS9Q9NV88 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
INTS9Q9NV88 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
INTS9Q9NV88 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
INTS9Q9NV88 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
INTS9Q9NV88 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
INTS9Q9NV88 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
INTS9Q9NV88 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
INTS9Q9NV88 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
INTS9Q9NV88 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
INTS9Q9NV88 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms