Protein–RNA interactions for Protein: Q9NV12

TMEM140, Transmembrane protein 140, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM140Q9NV12 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMEM140Q9NV12 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMEM140Q9NV12 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMEM140Q9NV12 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMEM140Q9NV12 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMEM140Q9NV12 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMEM140Q9NV12 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMEM140Q9NV12 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
TMEM140Q9NV12 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMEM140Q9NV12 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMEM140Q9NV12 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
TMEM140Q9NV12 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMEM140Q9NV12 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMEM140Q9NV12 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMEM140Q9NV12 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMEM140Q9NV12 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMEM140Q9NV12 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
TMEM140Q9NV12 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMEM140Q9NV12 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMEM140Q9NV12 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMEM140Q9NV12 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMEM140Q9NV12 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMEM140Q9NV12 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMEM140Q9NV12 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMEM140Q9NV12 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
TMEM140Q9NV12 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMEM140Q9NV12 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMEM140Q9NV12 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
TMEM140Q9NV12 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TMEM140Q9NV12 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMEM140Q9NV12 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMEM140Q9NV12 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMEM140Q9NV12 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMEM140Q9NV12 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMEM140Q9NV12 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
TMEM140Q9NV12 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMEM140Q9NV12 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMEM140Q9NV12 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMEM140Q9NV12 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMEM140Q9NV12 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMEM140Q9NV12 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMEM140Q9NV12 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMEM140Q9NV12 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMEM140Q9NV12 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMEM140Q9NV12 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TMEM140Q9NV12 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TMEM140Q9NV12 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TMEM140Q9NV12 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TMEM140Q9NV12 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TMEM140Q9NV12 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TMEM140Q9NV12 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TMEM140Q9NV12 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TMEM140Q9NV12 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TMEM140Q9NV12 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TMEM140Q9NV12 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TMEM140Q9NV12 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
TMEM140Q9NV12 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TMEM140Q9NV12 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC18■□□□□ 0.47
TMEM140Q9NV12 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TMEM140Q9NV12 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TMEM140Q9NV12 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TMEM140Q9NV12 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TMEM140Q9NV12 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TMEM140Q9NV12 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TMEM140Q9NV12 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TMEM140Q9NV12 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TMEM140Q9NV12 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM140Q9NV12 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM140Q9NV12 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM140Q9NV12 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM140Q9NV12 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM140Q9NV12 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM140Q9NV12 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM140Q9NV12 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM140Q9NV12 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM140Q9NV12 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM140Q9NV12 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM140Q9NV12 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM140Q9NV12 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM140Q9NV12 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM140Q9NV12 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM140Q9NV12 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM140Q9NV12 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMEM140Q9NV12 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMEM140Q9NV12 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMEM140Q9NV12 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMEM140Q9NV12 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
TMEM140Q9NV12 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMEM140Q9NV12 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMEM140Q9NV12 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMEM140Q9NV12 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMEM140Q9NV12 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMEM140Q9NV12 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMEM140Q9NV12 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMEM140Q9NV12 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMEM140Q9NV12 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMEM140Q9NV12 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMEM140Q9NV12 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
TMEM140Q9NV12 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMEM140Q9NV12 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms