Protein–RNA interactions for Protein: Q9NV06

DCAF13, DDB1- and CUL4-associated factor 13, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCAF13Q9NV06 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
DCAF13Q9NV06 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
DCAF13Q9NV06 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
DCAF13Q9NV06 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
DCAF13Q9NV06 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
DCAF13Q9NV06 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
DCAF13Q9NV06 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
DCAF13Q9NV06 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
DCAF13Q9NV06 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
DCAF13Q9NV06 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
DCAF13Q9NV06 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
DCAF13Q9NV06 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
DCAF13Q9NV06 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
DCAF13Q9NV06 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
DCAF13Q9NV06 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
DCAF13Q9NV06 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
DCAF13Q9NV06 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
DCAF13Q9NV06 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
DCAF13Q9NV06 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
DCAF13Q9NV06 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
DCAF13Q9NV06 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
DCAF13Q9NV06 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
DCAF13Q9NV06 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
DCAF13Q9NV06 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
DCAF13Q9NV06 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
DCAF13Q9NV06 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.92
DCAF13Q9NV06 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
DCAF13Q9NV06 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
DCAF13Q9NV06 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
DCAF13Q9NV06 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
DCAF13Q9NV06 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
DCAF13Q9NV06 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
DCAF13Q9NV06 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
DCAF13Q9NV06 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
DCAF13Q9NV06 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
DCAF13Q9NV06 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
DCAF13Q9NV06 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
DCAF13Q9NV06 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
DCAF13Q9NV06 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
DCAF13Q9NV06 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
DCAF13Q9NV06 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
DCAF13Q9NV06 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
DCAF13Q9NV06 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
DCAF13Q9NV06 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
DCAF13Q9NV06 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
DCAF13Q9NV06 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
DCAF13Q9NV06 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
DCAF13Q9NV06 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
DCAF13Q9NV06 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
DCAF13Q9NV06 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
DCAF13Q9NV06 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
DCAF13Q9NV06 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
DCAF13Q9NV06 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
DCAF13Q9NV06 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
DCAF13Q9NV06 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
DCAF13Q9NV06 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
DCAF13Q9NV06 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
DCAF13Q9NV06 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
DCAF13Q9NV06 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
DCAF13Q9NV06 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
DCAF13Q9NV06 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
DCAF13Q9NV06 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
DCAF13Q9NV06 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
DCAF13Q9NV06 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
DCAF13Q9NV06 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
DCAF13Q9NV06 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
DCAF13Q9NV06 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
DCAF13Q9NV06 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
DCAF13Q9NV06 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
DCAF13Q9NV06 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
DCAF13Q9NV06 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
DCAF13Q9NV06 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
DCAF13Q9NV06 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
DCAF13Q9NV06 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
DCAF13Q9NV06 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
DCAF13Q9NV06 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
DCAF13Q9NV06 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
DCAF13Q9NV06 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
DCAF13Q9NV06 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
DCAF13Q9NV06 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
DCAF13Q9NV06 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
DCAF13Q9NV06 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
DCAF13Q9NV06 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
DCAF13Q9NV06 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
DCAF13Q9NV06 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
DCAF13Q9NV06 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
DCAF13Q9NV06 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
DCAF13Q9NV06 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
DCAF13Q9NV06 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
DCAF13Q9NV06 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
DCAF13Q9NV06 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
DCAF13Q9NV06 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
DCAF13Q9NV06 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
DCAF13Q9NV06 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
DCAF13Q9NV06 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
DCAF13Q9NV06 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
DCAF13Q9NV06 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC20.77■□□□□ 0.91
DCAF13Q9NV06 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
DCAF13Q9NV06 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
DCAF13Q9NV06 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms