Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUG4

CCM2L, Cerebral cavernous malformations 2 protein-like, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCM2LQ9NUG4 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCM2LQ9NUG4 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCM2LQ9NUG4 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCM2LQ9NUG4 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCM2LQ9NUG4 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
CCM2LQ9NUG4 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCM2LQ9NUG4 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
CCM2LQ9NUG4 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCM2LQ9NUG4 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCM2LQ9NUG4 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCM2LQ9NUG4 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCM2LQ9NUG4 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCM2LQ9NUG4 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCM2LQ9NUG4 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCM2LQ9NUG4 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCM2LQ9NUG4 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCM2LQ9NUG4 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCM2LQ9NUG4 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCM2LQ9NUG4 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCM2LQ9NUG4 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCM2LQ9NUG4 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCM2LQ9NUG4 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCM2LQ9NUG4 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCM2LQ9NUG4 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCM2LQ9NUG4 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
CCM2LQ9NUG4 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCM2LQ9NUG4 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCM2LQ9NUG4 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCM2LQ9NUG4 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCM2LQ9NUG4 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCM2LQ9NUG4 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCM2LQ9NUG4 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCM2LQ9NUG4 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCM2LQ9NUG4 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCM2LQ9NUG4 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCM2LQ9NUG4 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCM2LQ9NUG4 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCM2LQ9NUG4 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCM2LQ9NUG4 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCM2LQ9NUG4 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCM2LQ9NUG4 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCM2LQ9NUG4 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCM2LQ9NUG4 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCM2LQ9NUG4 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCM2LQ9NUG4 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCM2LQ9NUG4 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCM2LQ9NUG4 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCM2LQ9NUG4 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCM2LQ9NUG4 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCM2LQ9NUG4 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCM2LQ9NUG4 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCM2LQ9NUG4 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCM2LQ9NUG4 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCM2LQ9NUG4 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCM2LQ9NUG4 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCM2LQ9NUG4 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCM2LQ9NUG4 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCM2LQ9NUG4 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCM2LQ9NUG4 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCM2LQ9NUG4 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CCM2LQ9NUG4 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CCM2LQ9NUG4 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCM2LQ9NUG4 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCM2LQ9NUG4 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCM2LQ9NUG4 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
CCM2LQ9NUG4 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCM2LQ9NUG4 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCM2LQ9NUG4 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCM2LQ9NUG4 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCM2LQ9NUG4 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCM2LQ9NUG4 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCM2LQ9NUG4 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCM2LQ9NUG4 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
CCM2LQ9NUG4 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCM2LQ9NUG4 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCM2LQ9NUG4 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCM2LQ9NUG4 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCM2LQ9NUG4 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCM2LQ9NUG4 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CCM2LQ9NUG4 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCM2LQ9NUG4 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCM2LQ9NUG4 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCM2LQ9NUG4 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCM2LQ9NUG4 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCM2LQ9NUG4 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCM2LQ9NUG4 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCM2LQ9NUG4 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCM2LQ9NUG4 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCM2LQ9NUG4 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CCM2LQ9NUG4 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCM2LQ9NUG4 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CCM2LQ9NUG4 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCM2LQ9NUG4 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCM2LQ9NUG4 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCM2LQ9NUG4 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CCM2LQ9NUG4 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCM2LQ9NUG4 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCM2LQ9NUG4 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCM2LQ9NUG4 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCM2LQ9NUG4 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms