Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTJ3

SMC4, Structural maintenance of chromosomes protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC4Q9NTJ3 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SMC4Q9NTJ3 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
SMC4Q9NTJ3 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SMC4Q9NTJ3 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
SMC4Q9NTJ3 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
SMC4Q9NTJ3 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
SMC4Q9NTJ3 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
SMC4Q9NTJ3 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SMC4Q9NTJ3 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
SMC4Q9NTJ3 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
SMC4Q9NTJ3 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SMC4Q9NTJ3 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SMC4Q9NTJ3 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC28.65■■■□□ 2.18
SMC4Q9NTJ3 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
SMC4Q9NTJ3 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
SMC4Q9NTJ3 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
SMC4Q9NTJ3 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
SMC4Q9NTJ3 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
SMC4Q9NTJ3 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
SMC4Q9NTJ3 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
SMC4Q9NTJ3 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
SMC4Q9NTJ3 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
SMC4Q9NTJ3 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SMC4Q9NTJ3 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SMC4Q9NTJ3 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
SMC4Q9NTJ3 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SMC4Q9NTJ3 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SMC4Q9NTJ3 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SMC4Q9NTJ3 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SMC4Q9NTJ3 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
SMC4Q9NTJ3 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
SMC4Q9NTJ3 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SMC4Q9NTJ3 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
SMC4Q9NTJ3 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
SMC4Q9NTJ3 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SMC4Q9NTJ3 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
SMC4Q9NTJ3 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
SMC4Q9NTJ3 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
SMC4Q9NTJ3 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC28.62■■■□□ 2.17
SMC4Q9NTJ3 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
SMC4Q9NTJ3 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
SMC4Q9NTJ3 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SMC4Q9NTJ3 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
SMC4Q9NTJ3 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SMC4Q9NTJ3 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
SMC4Q9NTJ3 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SMC4Q9NTJ3 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SMC4Q9NTJ3 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
SMC4Q9NTJ3 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC28.61■■■□□ 2.17
SMC4Q9NTJ3 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
SMC4Q9NTJ3 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SMC4Q9NTJ3 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SMC4Q9NTJ3 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SMC4Q9NTJ3 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SMC4Q9NTJ3 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SMC4Q9NTJ3 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SMC4Q9NTJ3 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SMC4Q9NTJ3 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SMC4Q9NTJ3 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SMC4Q9NTJ3 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SMC4Q9NTJ3 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SMC4Q9NTJ3 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SMC4Q9NTJ3 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SMC4Q9NTJ3 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SMC4Q9NTJ3 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SMC4Q9NTJ3 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SMC4Q9NTJ3 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SMC4Q9NTJ3 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SMC4Q9NTJ3 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
SMC4Q9NTJ3 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SMC4Q9NTJ3 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SMC4Q9NTJ3 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SMC4Q9NTJ3 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SMC4Q9NTJ3 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SMC4Q9NTJ3 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SMC4Q9NTJ3 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SMC4Q9NTJ3 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SMC4Q9NTJ3 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SMC4Q9NTJ3 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SMC4Q9NTJ3 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SMC4Q9NTJ3 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SMC4Q9NTJ3 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SMC4Q9NTJ3 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SMC4Q9NTJ3 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SMC4Q9NTJ3 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SMC4Q9NTJ3 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SMC4Q9NTJ3 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SMC4Q9NTJ3 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SMC4Q9NTJ3 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SMC4Q9NTJ3 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
SMC4Q9NTJ3 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
SMC4Q9NTJ3 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SMC4Q9NTJ3 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SMC4Q9NTJ3 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SMC4Q9NTJ3 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SMC4Q9NTJ3 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SMC4Q9NTJ3 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SMC4Q9NTJ3 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SMC4Q9NTJ3 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SMC4Q9NTJ3 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms