Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTI2

ATP8A2, Phospholipid-transporting ATPase IB, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP8A2Q9NTI2 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
ATP8A2Q9NTI2 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
ATP8A2Q9NTI2 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ATP8A2Q9NTI2 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
ATP8A2Q9NTI2 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ATP8A2Q9NTI2 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ATP8A2Q9NTI2 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ATP8A2Q9NTI2 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ATP8A2Q9NTI2 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ATP8A2Q9NTI2 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ATP8A2Q9NTI2 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ATP8A2Q9NTI2 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ATP8A2Q9NTI2 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ATP8A2Q9NTI2 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ATP8A2Q9NTI2 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ATP8A2Q9NTI2 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ATP8A2Q9NTI2 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ATP8A2Q9NTI2 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ATP8A2Q9NTI2 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ATP8A2Q9NTI2 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ATP8A2Q9NTI2 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ATP8A2Q9NTI2 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ATP8A2Q9NTI2 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
ATP8A2Q9NTI2 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ATP8A2Q9NTI2 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ATP8A2Q9NTI2 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ATP8A2Q9NTI2 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ATP8A2Q9NTI2 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ATP8A2Q9NTI2 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ATP8A2Q9NTI2 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ATP8A2Q9NTI2 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ATP8A2Q9NTI2 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ATP8A2Q9NTI2 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ATP8A2Q9NTI2 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ATP8A2Q9NTI2 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ATP8A2Q9NTI2 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ATP8A2Q9NTI2 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ATP8A2Q9NTI2 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ATP8A2Q9NTI2 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ATP8A2Q9NTI2 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ATP8A2Q9NTI2 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ATP8A2Q9NTI2 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ATP8A2Q9NTI2 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ATP8A2Q9NTI2 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
ATP8A2Q9NTI2 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ATP8A2Q9NTI2 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ATP8A2Q9NTI2 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ATP8A2Q9NTI2 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ATP8A2Q9NTI2 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ATP8A2Q9NTI2 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ATP8A2Q9NTI2 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
ATP8A2Q9NTI2 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
ATP8A2Q9NTI2 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
ATP8A2Q9NTI2 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
ATP8A2Q9NTI2 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
ATP8A2Q9NTI2 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
ATP8A2Q9NTI2 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
ATP8A2Q9NTI2 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
ATP8A2Q9NTI2 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ATP8A2Q9NTI2 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ATP8A2Q9NTI2 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ATP8A2Q9NTI2 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ATP8A2Q9NTI2 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
ATP8A2Q9NTI2 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ATP8A2Q9NTI2 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ATP8A2Q9NTI2 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
ATP8A2Q9NTI2 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ATP8A2Q9NTI2 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ATP8A2Q9NTI2 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ATP8A2Q9NTI2 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ATP8A2Q9NTI2 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ATP8A2Q9NTI2 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ATP8A2Q9NTI2 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ATP8A2Q9NTI2 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ATP8A2Q9NTI2 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ATP8A2Q9NTI2 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ATP8A2Q9NTI2 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ATP8A2Q9NTI2 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ATP8A2Q9NTI2 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ATP8A2Q9NTI2 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ATP8A2Q9NTI2 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ATP8A2Q9NTI2 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ATP8A2Q9NTI2 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ATP8A2Q9NTI2 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ATP8A2Q9NTI2 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ATP8A2Q9NTI2 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ATP8A2Q9NTI2 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ATP8A2Q9NTI2 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ATP8A2Q9NTI2 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ATP8A2Q9NTI2 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ATP8A2Q9NTI2 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ATP8A2Q9NTI2 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ATP8A2Q9NTI2 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ATP8A2Q9NTI2 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ATP8A2Q9NTI2 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ATP8A2Q9NTI2 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ATP8A2Q9NTI2 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ATP8A2Q9NTI2 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ATP8A2Q9NTI2 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ATP8A2Q9NTI2 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms