Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSD9

FARSB, Phenylalanine--tRNA ligase beta subunit, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FARSBQ9NSD9 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
FARSBQ9NSD9 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
FARSBQ9NSD9 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
FARSBQ9NSD9 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
FARSBQ9NSD9 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FARSBQ9NSD9 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FARSBQ9NSD9 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FARSBQ9NSD9 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FARSBQ9NSD9 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
FARSBQ9NSD9 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FARSBQ9NSD9 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
FARSBQ9NSD9 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
FARSBQ9NSD9 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
FARSBQ9NSD9 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
FARSBQ9NSD9 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
FARSBQ9NSD9 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
FARSBQ9NSD9 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
FARSBQ9NSD9 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
FARSBQ9NSD9 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
FARSBQ9NSD9 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FARSBQ9NSD9 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FARSBQ9NSD9 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FARSBQ9NSD9 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
FARSBQ9NSD9 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
FARSBQ9NSD9 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FARSBQ9NSD9 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
FARSBQ9NSD9 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FARSBQ9NSD9 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
FARSBQ9NSD9 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
FARSBQ9NSD9 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
FARSBQ9NSD9 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
FARSBQ9NSD9 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FARSBQ9NSD9 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FARSBQ9NSD9 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FARSBQ9NSD9 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FARSBQ9NSD9 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
FARSBQ9NSD9 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
FARSBQ9NSD9 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FARSBQ9NSD9 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FARSBQ9NSD9 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FARSBQ9NSD9 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FARSBQ9NSD9 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FARSBQ9NSD9 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FARSBQ9NSD9 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FARSBQ9NSD9 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FARSBQ9NSD9 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FARSBQ9NSD9 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FARSBQ9NSD9 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FARSBQ9NSD9 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FARSBQ9NSD9 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FARSBQ9NSD9 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FARSBQ9NSD9 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FARSBQ9NSD9 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FARSBQ9NSD9 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FARSBQ9NSD9 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FARSBQ9NSD9 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FARSBQ9NSD9 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FARSBQ9NSD9 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FARSBQ9NSD9 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FARSBQ9NSD9 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FARSBQ9NSD9 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FARSBQ9NSD9 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
FARSBQ9NSD9 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FARSBQ9NSD9 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FARSBQ9NSD9 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FARSBQ9NSD9 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FARSBQ9NSD9 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FARSBQ9NSD9 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FARSBQ9NSD9 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FARSBQ9NSD9 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FARSBQ9NSD9 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FARSBQ9NSD9 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FARSBQ9NSD9 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FARSBQ9NSD9 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FARSBQ9NSD9 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FARSBQ9NSD9 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FARSBQ9NSD9 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FARSBQ9NSD9 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FARSBQ9NSD9 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FARSBQ9NSD9 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FARSBQ9NSD9 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FARSBQ9NSD9 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FARSBQ9NSD9 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FARSBQ9NSD9 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FARSBQ9NSD9 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FARSBQ9NSD9 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FARSBQ9NSD9 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FARSBQ9NSD9 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FARSBQ9NSD9 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FARSBQ9NSD9 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FARSBQ9NSD9 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FARSBQ9NSD9 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FARSBQ9NSD9 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FARSBQ9NSD9 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
FARSBQ9NSD9 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
FARSBQ9NSD9 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FARSBQ9NSD9 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FARSBQ9NSD9 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FARSBQ9NSD9 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FARSBQ9NSD9 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms