Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS71

GKN1, Gastrokine-1, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GKN1Q9NS71 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GKN1Q9NS71 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GKN1Q9NS71 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GKN1Q9NS71 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GKN1Q9NS71 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GKN1Q9NS71 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GKN1Q9NS71 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GKN1Q9NS71 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GKN1Q9NS71 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GKN1Q9NS71 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GKN1Q9NS71 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
GKN1Q9NS71 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GKN1Q9NS71 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GKN1Q9NS71 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
GKN1Q9NS71 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GKN1Q9NS71 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GKN1Q9NS71 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GKN1Q9NS71 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GKN1Q9NS71 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GKN1Q9NS71 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GKN1Q9NS71 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GKN1Q9NS71 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GKN1Q9NS71 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GKN1Q9NS71 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GKN1Q9NS71 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GKN1Q9NS71 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GKN1Q9NS71 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GKN1Q9NS71 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GKN1Q9NS71 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GKN1Q9NS71 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GKN1Q9NS71 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GKN1Q9NS71 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GKN1Q9NS71 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GKN1Q9NS71 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GKN1Q9NS71 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
GKN1Q9NS71 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GKN1Q9NS71 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GKN1Q9NS71 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GKN1Q9NS71 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GKN1Q9NS71 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GKN1Q9NS71 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
GKN1Q9NS71 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GKN1Q9NS71 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
GKN1Q9NS71 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GKN1Q9NS71 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GKN1Q9NS71 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
GKN1Q9NS71 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GKN1Q9NS71 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
GKN1Q9NS71 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GKN1Q9NS71 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GKN1Q9NS71 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GKN1Q9NS71 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GKN1Q9NS71 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GKN1Q9NS71 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GKN1Q9NS71 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GKN1Q9NS71 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GKN1Q9NS71 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GKN1Q9NS71 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GKN1Q9NS71 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GKN1Q9NS71 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GKN1Q9NS71 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GKN1Q9NS71 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GKN1Q9NS71 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GKN1Q9NS71 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GKN1Q9NS71 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GKN1Q9NS71 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GKN1Q9NS71 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GKN1Q9NS71 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GKN1Q9NS71 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GKN1Q9NS71 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GKN1Q9NS71 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GKN1Q9NS71 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GKN1Q9NS71 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
GKN1Q9NS71 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GKN1Q9NS71 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GKN1Q9NS71 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GKN1Q9NS71 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GKN1Q9NS71 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GKN1Q9NS71 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GKN1Q9NS71 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GKN1Q9NS71 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GKN1Q9NS71 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GKN1Q9NS71 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GKN1Q9NS71 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
GKN1Q9NS71 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GKN1Q9NS71 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GKN1Q9NS71 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GKN1Q9NS71 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GKN1Q9NS71 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GKN1Q9NS71 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GKN1Q9NS71 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GKN1Q9NS71 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GKN1Q9NS71 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GKN1Q9NS71 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GKN1Q9NS71 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GKN1Q9NS71 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GKN1Q9NS71 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GKN1Q9NS71 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
GKN1Q9NS71 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GKN1Q9NS71 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms