Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRX4

PHPT1, 14 kDa phosphohistidine phosphatase, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHPT1Q9NRX4 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PHPT1Q9NRX4 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PHPT1Q9NRX4 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PHPT1Q9NRX4 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PHPT1Q9NRX4 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PHPT1Q9NRX4 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PHPT1Q9NRX4 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PHPT1Q9NRX4 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PHPT1Q9NRX4 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PHPT1Q9NRX4 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PHPT1Q9NRX4 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PHPT1Q9NRX4 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PHPT1Q9NRX4 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PHPT1Q9NRX4 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PHPT1Q9NRX4 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PHPT1Q9NRX4 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PHPT1Q9NRX4 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PHPT1Q9NRX4 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PHPT1Q9NRX4 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PHPT1Q9NRX4 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PHPT1Q9NRX4 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PHPT1Q9NRX4 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PHPT1Q9NRX4 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PHPT1Q9NRX4 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PHPT1Q9NRX4 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PHPT1Q9NRX4 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PHPT1Q9NRX4 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PHPT1Q9NRX4 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PHPT1Q9NRX4 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PHPT1Q9NRX4 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PHPT1Q9NRX4 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PHPT1Q9NRX4 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PHPT1Q9NRX4 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PHPT1Q9NRX4 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PHPT1Q9NRX4 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PHPT1Q9NRX4 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PHPT1Q9NRX4 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PHPT1Q9NRX4 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PHPT1Q9NRX4 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PHPT1Q9NRX4 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PHPT1Q9NRX4 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PHPT1Q9NRX4 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PHPT1Q9NRX4 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PHPT1Q9NRX4 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PHPT1Q9NRX4 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PHPT1Q9NRX4 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PHPT1Q9NRX4 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PHPT1Q9NRX4 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PHPT1Q9NRX4 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PHPT1Q9NRX4 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PHPT1Q9NRX4 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.11
PHPT1Q9NRX4 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PHPT1Q9NRX4 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PHPT1Q9NRX4 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PHPT1Q9NRX4 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PHPT1Q9NRX4 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PHPT1Q9NRX4 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PHPT1Q9NRX4 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PHPT1Q9NRX4 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PHPT1Q9NRX4 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PHPT1Q9NRX4 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PHPT1Q9NRX4 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PHPT1Q9NRX4 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PHPT1Q9NRX4 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PHPT1Q9NRX4 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PHPT1Q9NRX4 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PHPT1Q9NRX4 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PHPT1Q9NRX4 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PHPT1Q9NRX4 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PHPT1Q9NRX4 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
PHPT1Q9NRX4 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PHPT1Q9NRX4 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PHPT1Q9NRX4 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PHPT1Q9NRX4 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PHPT1Q9NRX4 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PHPT1Q9NRX4 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PHPT1Q9NRX4 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PHPT1Q9NRX4 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PHPT1Q9NRX4 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PHPT1Q9NRX4 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PHPT1Q9NRX4 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PHPT1Q9NRX4 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PHPT1Q9NRX4 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PHPT1Q9NRX4 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PHPT1Q9NRX4 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PHPT1Q9NRX4 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PHPT1Q9NRX4 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PHPT1Q9NRX4 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PHPT1Q9NRX4 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PHPT1Q9NRX4 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PHPT1Q9NRX4 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PHPT1Q9NRX4 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PHPT1Q9NRX4 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PHPT1Q9NRX4 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PHPT1Q9NRX4 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PHPT1Q9NRX4 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PHPT1Q9NRX4 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PHPT1Q9NRX4 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PHPT1Q9NRX4 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PHPT1Q9NRX4 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms