Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR80

ARHGEF4, Rho guanine nucleotide exchange factor 4, humanhuman

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Length 690 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF4Q9NR80 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARHGEF4Q9NR80 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARHGEF4Q9NR80 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARHGEF4Q9NR80 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARHGEF4Q9NR80 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
ARHGEF4Q9NR80 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ARHGEF4Q9NR80 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
ARHGEF4Q9NR80 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ARHGEF4Q9NR80 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ARHGEF4Q9NR80 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ARHGEF4Q9NR80 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ARHGEF4Q9NR80 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ARHGEF4Q9NR80 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ARHGEF4Q9NR80 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ARHGEF4Q9NR80 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ARHGEF4Q9NR80 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ARHGEF4Q9NR80 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ARHGEF4Q9NR80 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ARHGEF4Q9NR80 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ARHGEF4Q9NR80 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ARHGEF4Q9NR80 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ARHGEF4Q9NR80 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ARHGEF4Q9NR80 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ARHGEF4Q9NR80 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ARHGEF4Q9NR80 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ARHGEF4Q9NR80 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ARHGEF4Q9NR80 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
ARHGEF4Q9NR80 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ARHGEF4Q9NR80 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ARHGEF4Q9NR80 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
ARHGEF4Q9NR80 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ARHGEF4Q9NR80 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ARHGEF4Q9NR80 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ARHGEF4Q9NR80 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ARHGEF4Q9NR80 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ARHGEF4Q9NR80 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ARHGEF4Q9NR80 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
ARHGEF4Q9NR80 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ARHGEF4Q9NR80 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ARHGEF4Q9NR80 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ARHGEF4Q9NR80 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ARHGEF4Q9NR80 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ARHGEF4Q9NR80 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
ARHGEF4Q9NR80 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ARHGEF4Q9NR80 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ARHGEF4Q9NR80 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ARHGEF4Q9NR80 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ARHGEF4Q9NR80 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ARHGEF4Q9NR80 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ARHGEF4Q9NR80 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ARHGEF4Q9NR80 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ARHGEF4Q9NR80 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ARHGEF4Q9NR80 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ARHGEF4Q9NR80 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ARHGEF4Q9NR80 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ARHGEF4Q9NR80 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ARHGEF4Q9NR80 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ARHGEF4Q9NR80 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ARHGEF4Q9NR80 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ARHGEF4Q9NR80 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ARHGEF4Q9NR80 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ARHGEF4Q9NR80 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ARHGEF4Q9NR80 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ARHGEF4Q9NR80 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
ARHGEF4Q9NR80 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ARHGEF4Q9NR80 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ARHGEF4Q9NR80 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ARHGEF4Q9NR80 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ARHGEF4Q9NR80 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ARHGEF4Q9NR80 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ARHGEF4Q9NR80 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ARHGEF4Q9NR80 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
ARHGEF4Q9NR80 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ARHGEF4Q9NR80 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ARHGEF4Q9NR80 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ARHGEF4Q9NR80 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ARHGEF4Q9NR80 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ARHGEF4Q9NR80 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
ARHGEF4Q9NR80 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ARHGEF4Q9NR80 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
ARHGEF4Q9NR80 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
ARHGEF4Q9NR80 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ARHGEF4Q9NR80 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ARHGEF4Q9NR80 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ARHGEF4Q9NR80 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ARHGEF4Q9NR80 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ARHGEF4Q9NR80 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ARHGEF4Q9NR80 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ARHGEF4Q9NR80 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ARHGEF4Q9NR80 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ARHGEF4Q9NR80 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
ARHGEF4Q9NR80 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ARHGEF4Q9NR80 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
ARHGEF4Q9NR80 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ARHGEF4Q9NR80 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
ARHGEF4Q9NR80 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ARHGEF4Q9NR80 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ARHGEF4Q9NR80 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ARHGEF4Q9NR80 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ARHGEF4Q9NR80 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
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