Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQX7

ITM2C, Integral membrane protein 2C, humanhuman

Predictions only

Length 267 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITM2CQ9NQX7 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ITM2CQ9NQX7 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
ITM2CQ9NQX7 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ITM2CQ9NQX7 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ITM2CQ9NQX7 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
ITM2CQ9NQX7 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ITM2CQ9NQX7 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ITM2CQ9NQX7 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ITM2CQ9NQX7 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ITM2CQ9NQX7 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ITM2CQ9NQX7 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
ITM2CQ9NQX7 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ITM2CQ9NQX7 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ITM2CQ9NQX7 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ITM2CQ9NQX7 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ITM2CQ9NQX7 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ITM2CQ9NQX7 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ITM2CQ9NQX7 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ITM2CQ9NQX7 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
ITM2CQ9NQX7 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ITM2CQ9NQX7 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ITM2CQ9NQX7 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ITM2CQ9NQX7 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
ITM2CQ9NQX7 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ITM2CQ9NQX7 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ITM2CQ9NQX7 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ITM2CQ9NQX7 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ITM2CQ9NQX7 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ITM2CQ9NQX7 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ITM2CQ9NQX7 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ITM2CQ9NQX7 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ITM2CQ9NQX7 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ITM2CQ9NQX7 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ITM2CQ9NQX7 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ITM2CQ9NQX7 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ITM2CQ9NQX7 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ITM2CQ9NQX7 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ITM2CQ9NQX7 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ITM2CQ9NQX7 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ITM2CQ9NQX7 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ITM2CQ9NQX7 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ITM2CQ9NQX7 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ITM2CQ9NQX7 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
ITM2CQ9NQX7 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ITM2CQ9NQX7 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
ITM2CQ9NQX7 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ITM2CQ9NQX7 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ITM2CQ9NQX7 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ITM2CQ9NQX7 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ITM2CQ9NQX7 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ITM2CQ9NQX7 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ITM2CQ9NQX7 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ITM2CQ9NQX7 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ITM2CQ9NQX7 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ITM2CQ9NQX7 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ITM2CQ9NQX7 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ITM2CQ9NQX7 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ITM2CQ9NQX7 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ITM2CQ9NQX7 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ITM2CQ9NQX7 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ITM2CQ9NQX7 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ITM2CQ9NQX7 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
ITM2CQ9NQX7 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ITM2CQ9NQX7 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ITM2CQ9NQX7 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ITM2CQ9NQX7 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ITM2CQ9NQX7 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ITM2CQ9NQX7 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
ITM2CQ9NQX7 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ITM2CQ9NQX7 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
ITM2CQ9NQX7 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ITM2CQ9NQX7 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ITM2CQ9NQX7 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ITM2CQ9NQX7 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
ITM2CQ9NQX7 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ITM2CQ9NQX7 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ITM2CQ9NQX7 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ITM2CQ9NQX7 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ITM2CQ9NQX7 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ITM2CQ9NQX7 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ITM2CQ9NQX7 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ITM2CQ9NQX7 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ITM2CQ9NQX7 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ITM2CQ9NQX7 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ITM2CQ9NQX7 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ITM2CQ9NQX7 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ITM2CQ9NQX7 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ITM2CQ9NQX7 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ITM2CQ9NQX7 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ITM2CQ9NQX7 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ITM2CQ9NQX7 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ITM2CQ9NQX7 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ITM2CQ9NQX7 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ITM2CQ9NQX7 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ITM2CQ9NQX7 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ITM2CQ9NQX7 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ITM2CQ9NQX7 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ITM2CQ9NQX7 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ITM2CQ9NQX7 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ITM2CQ9NQX7 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.8 ms